Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPS1L1P21108 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPS1L1P21108 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPS1L1P21108 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRPS1L1P21108 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPS1L1P21108 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms