Protein–RNA interactions for Protein: P13726

F3, Tissue factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P13726 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F3P13726 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
F3P13726 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
F3P13726 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
F3P13726 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
F3P13726 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
F3P13726 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F3P13726 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F3P13726 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F3P13726 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F3P13726 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F3P13726 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
F3P13726 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
F3P13726 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F3P13726 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F3P13726 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
F3P13726 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
F3P13726 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
F3P13726 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
F3P13726 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
F3P13726 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
F3P13726 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F3P13726 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
F3P13726 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
F3P13726 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F3P13726 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
F3P13726 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
F3P13726 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F3P13726 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
F3P13726 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
F3P13726 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
F3P13726 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F3P13726 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F3P13726 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
F3P13726 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
F3P13726 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
F3P13726 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F3P13726 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F3P13726 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
F3P13726 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
F3P13726 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
F3P13726 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F3P13726 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
F3P13726 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F3P13726 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F3P13726 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
F3P13726 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F3P13726 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
F3P13726 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
F3P13726 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
F3P13726 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F3P13726 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
F3P13726 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
F3P13726 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
F3P13726 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F3P13726 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F3P13726 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
F3P13726 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F3P13726 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
F3P13726 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F3P13726 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
F3P13726 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
F3P13726 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F3P13726 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
F3P13726 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
F3P13726 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
F3P13726 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
F3P13726 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F3P13726 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
F3P13726 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F3P13726 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
F3P13726 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F3P13726 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
F3P13726 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
F3P13726 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
F3P13726 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F3P13726 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
F3P13726 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
F3P13726 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F3P13726 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F3P13726 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
F3P13726 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F3P13726 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F3P13726 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F3P13726 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
F3P13726 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
F3P13726 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F3P13726 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms