Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OPN1SWP03999 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OPN1SWP03999 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPN1SWP03999 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
OPN1SWP03999 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPN1SWP03999 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms