Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TP73O15350 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TP73O15350 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TP73O15350 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TP73O15350 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TP73O15350 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TP73O15350 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TP73O15350 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TP73O15350 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP73O15350 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP73O15350 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP73O15350 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP73O15350 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP73O15350 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP73O15350 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP73O15350 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP73O15350 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP73O15350 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TP73O15350 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TP73O15350 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TP73O15350 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TP73O15350 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TP73O15350 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TP73O15350 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TP73O15350 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TP73O15350 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TP73O15350 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TP73O15350 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TP73O15350 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TP73O15350 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TP73O15350 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TP73O15350 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TP73O15350 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TP73O15350 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TP73O15350 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TP73O15350 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TP73O15350 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TP73O15350 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TP73O15350 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TP73O15350 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TP73O15350 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TP73O15350 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TP73O15350 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TP73O15350 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TP73O15350 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TP73O15350 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP73O15350 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP73O15350 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP73O15350 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP73O15350 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP73O15350 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP73O15350 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TP73O15350 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TP73O15350 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TP73O15350 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TP73O15350 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TP73O15350 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TP73O15350 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TP73O15350 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TP73O15350 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TP73O15350 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TP73O15350 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TP73O15350 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TP73O15350 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TP73O15350 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TP73O15350 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TP73O15350 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TP73O15350 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TP73O15350 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TP73O15350 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TP73O15350 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TP73O15350 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TP73O15350 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TP73O15350 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TP73O15350 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TP73O15350 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TP73O15350 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TP73O15350 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP73O15350 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP73O15350 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP73O15350 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP73O15350 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP73O15350 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TP73O15350 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TP73O15350 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TP73O15350 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TP73O15350 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TP73O15350 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TP73O15350 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TP73O15350 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TP73O15350 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TP73O15350 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TP73O15350 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TP73O15350 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TP73O15350 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TP73O15350 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TP73O15350 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TP73O15350 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TP73O15350 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TP73O15350 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms