Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3QRE1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3QRE1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3QRE1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3QRE1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3QRE1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
J3QRE1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3QRE1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3QRE1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3QRE1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QRE1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QRE1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QRE1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QRE1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QRE1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QRE1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3QRE1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3QRE1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3QRE1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3QRE1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QRE1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QRE1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QRE1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QRE1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QRE1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3QRE1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3QRE1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3QRE1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QRE1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QRE1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QRE1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3QRE1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
J3QRE1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
J3QRE1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRE1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRE1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRE1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRE1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRE1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRE1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRE1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRE1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QRE1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QRE1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QRE1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QRE1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QRE1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QRE1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QRE1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QRE1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3QRE1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3QRE1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QRE1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QRE1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QRE1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QRE1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QRE1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QRE1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QRE1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QRE1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QRE1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QRE1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QRE1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QRE1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
J3QRE1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRE1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRE1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRE1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRE1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRE1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRE1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
J3QRE1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRE1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRE1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRE1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRE1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRE1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
J3QRE1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QRE1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QRE1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
J3QRE1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
J3QRE1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
J3QRE1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRE1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRE1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRE1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRE1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRE1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRE1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRE1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
J3QRE1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
J3QRE1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QRE1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QRE1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QRE1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
J3QRE1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QRE1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QRE1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QRE1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
J3QRE1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms