Protein–RNA interactions for Protein: A6NIJ5

FAM90A20P, Putative protein FAM90A20P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A20PA6NIJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM90A20PA6NIJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM90A20PA6NIJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM90A20PA6NIJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FAM90A20PA6NIJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms