Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMX3A6NHT5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMX3A6NHT5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMX3A6NHT5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HMX3A6NHT5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMX3A6NHT5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms