Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC13A5PLN9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC13A5PLN9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC13A5PLN9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC13A5PLN9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAPPC13A5PLN9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms