Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTP4A2Q12974 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PTP4A2Q12974 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PTP4A2Q12974 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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PTP4A2Q12974 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTP4A2Q12974 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTP4A2Q12974 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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