Protein–RNA interactions for Protein: Q12340

YRM1, Zinc finger transcription factor YRM1, yeastyeast

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRM1Q12340 YOR302WYOR302W 78 nt1.15□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YBR206WYBR206W 324 nt1.15□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YGR130CYGR130C 2451 nt1.15□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 SCC2YDR180W 4482 nt1.15□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 APL3YBL037W 3078 nt1.14□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 RPS27BYHR021C 249 nt1.14□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YLL020CYLL020C 306 nt1.14□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YNL028WYNL028W 318 nt1.14□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YNL198CYNL198C 303 nt1.14□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 SLD3YGL113W 2007 nt1.13□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 SET3YKR029C 2256 nt1.13□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.13□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YOR225WYOR225W 330 nt1.13□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YBR064WYBR064W 429 nt1.13□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 FIG4YNL325C 2640 nt1.13□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 KAP120YPL125W 3099 nt1.12□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 NUP145YGL092W 3954 nt1.12□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 PDE2YOR360C 1581 nt1.12□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YJR029WYJR029W 5268 nt1.12□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.12□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YAR009CYAR009C 3591 nt1.11□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 PAM16YJL104W 450 nt1.11□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.11□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 HUG1YML058W-A 207 nt1.11□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YOR218CYOR218C 420 nt1.11□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.11□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 STO1YMR125W 2586 nt1.1□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 snR74snR74 88 nt1.1□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.1□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 IES4YOR189W 351 nt1.1□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 RPL33BYOR234C 324 nt1.1□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 CDC39YCR093W 6327 nt1.09□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 ABF2YMR072W 552 nt1.09□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 YPR117WYPR117W 7470 nt1.09□□□□□ -2.23
YRM1Q12340 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.08□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 SPG3YDR504C 384 nt1.08□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 STF2YGR008C 255 nt1.08□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.07□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 EAF1YDR359C 2949 nt1.06□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt1.06□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 YGL052WYGL052W 306 nt1.06□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.06□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 STB6YKL072W 2301 nt1.06□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 Q0032Q0032 291 nt1.05□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.05□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 WAR1YML076C 2835 nt1.04□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.04□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 APQ12YIL040W 417 nt1.04□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 SPT7YBR081C 3999 nt1.03□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.03□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.03□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 snR49snR49 165 nt1.03□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 MCM10YIL150C 1716 nt1.03□□□□□ -2.24
YRM1Q12340 OLI1Q0130 231 nt1.01□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 ECM12YHR021W-A 456 nt1.01□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 YJL150WYJL150W 303 nt1.01□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 YPR092WYPR092W 306 nt1.01□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.01□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 SIP4YJL089W 2490 nt1□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 YDL073WYDL073W 2955 nt0.99□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt0.99□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 SGF11YPL047W 300 nt0.99□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt0.98□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 SMC1YFL008W 3678 nt0.98□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt0.97□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.97□□□□□ -2.25
YRM1Q12340 snR55snR55 98 nt0.96□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt0.96□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt0.96□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YBL053WYBL053W 375 nt0.96□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YNL211CYNL211C 261 nt0.96□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.96□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 NOP9YJL010C 2001 nt0.96□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt0.95□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 CMC4YMR194C-B 222 nt0.95□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YOR345CYOR345C 351 nt0.95□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 RKR1YMR247C 4689 nt0.95□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 PAA1YDR071C 576 nt0.94□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 BLI1YKL061W 342 nt0.94□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt0.94□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.94□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YLR294CYLR294C 330 nt0.94□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YPL044CYPL044C 549 nt0.94□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YKU70YMR284W 1809 nt0.94□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 GEA2YEL022W 4380 nt0.93□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 ISD11YER048W-A 285 nt0.92□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt0.92□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 ASE1YOR058C 2658 nt0.92□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 UTP20YBL004W 7482 nt0.91□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.91□□□□□ -2.26
YRM1Q12340 PMP1YCR024C-A 123 nt0.9□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YDL196WYDL196W 330 nt0.9□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 RPS30BYOR182C 192 nt0.9□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt0.9□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 PRP39YML046W 1890 nt0.89□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 RPL26BYGR034W 384 nt0.89□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YNL337WYNL337W 255 nt0.89□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YNL338WYNL338W 159 nt0.89□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 TRS65YGR166W 1683 nt0.88□□□□□ -2.27
YRM1Q12340 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.3 ms