Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TNIKQ9UKE5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TNIKQ9UKE5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms