Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXD3Q9UJU5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms