Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD1Q15797 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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