Protein–RNA interactions for Protein: Q12513

TMA17, Translation machinery-associated protein 17, yeastyeast

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA17Q12513 LRE1YCL051W 1752 nt1.71□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 SAP190YKR028W 3102 nt1.71□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 SWI4YER111C 3282 nt1.7□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 YGR069WYGR069W 336 nt1.7□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 YPP1YGR198W 2454 nt1.7□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 APL5YPL195W 2799 nt1.7□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 PIP2YOR363C 2991 nt1.7□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 YDR521WYDR521W 336 nt1.69□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 RPS27BYHR021C 249 nt1.69□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 YJL120WYJL120W 324 nt1.69□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 AZF1YOR113W 2745 nt1.69□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 YJL015CYJL015C 285 nt1.68□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.68□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 PEP1YBL017C 4740 nt1.67□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 SBE22YHR103W 2559 nt1.67□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 NUP145YGL092W 3954 nt1.67□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 CDC25YLR310C 4770 nt1.67□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 YDL206WYDL206W 2289 nt1.66□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 INA22YIR024C 651 nt1.66□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 UTP22YGR090W 3714 nt1.65□□□□□ -2.14
TMA17Q12513 SEC3YER008C 4011 nt1.65□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 CDC36YDL165W 576 nt1.65□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 SPO21YOL091W 1830 nt1.64□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.64□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.64□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 PDE2YOR360C 1581 nt1.64□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YCR022CYCR022C 345 nt1.63□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 IES4YOR189W 351 nt1.63□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 snR14snR14 160 nt1.63□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 FIG4YNL325C 2640 nt1.62□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.62□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YOR282WYOR282W 321 nt1.62□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 VPS15YBR097W 4365 nt1.61□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.6□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.6□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YBR174CYBR174C 315 nt1.6□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YBR206WYBR206W 324 nt1.6□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 CFT1YDR301W 4074 nt1.6□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 SET3YKR029C 2256 nt1.6□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 GYP5YPL249C 2685 nt1.6□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 APL3YBL037W 3078 nt1.6□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 CHS1YNL192W 3396 nt1.59□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 BRR2YER172C 6492 nt1.59□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YAR009CYAR009C 3591 nt1.59□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.59□□□□□ -2.15
TMA17Q12513 RTP1YMR185W 2946 nt1.59□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 MCM10YIL150C 1716 nt1.58□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.58□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.58□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.57□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.57□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.57□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 snR49snR49 165 nt1.57□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 STO1YMR125W 2586 nt1.57□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 SPC110YDR356W 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 SLD3YGL113W 2007 nt1.56□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 YGL052WYGL052W 306 nt1.56□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 YLR419WYLR419W 4308 nt1.55□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 YLL020CYLL020C 306 nt1.55□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 NUP188YML103C 4968 nt1.55□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 TRM732YMR259C 4263 nt1.54□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 SSK2YNR031C 4740 nt1.54□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 RRT15YLR162W-A 189 nt1.53□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 YBR064WYBR064W 429 nt1.53□□□□□ -2.16
TMA17Q12513 PMD1YER132C 5262 nt1.52□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 snR8snR8 190 nt1.52□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.52□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 YOR015WYOR015W 360 nt1.52□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 SMC1YFL008W 3678 nt1.51□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 SEC21YNL287W 2808 nt1.51□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 BPH1YCR032W 6504 nt1.51□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 YPR092WYPR092W 306 nt1.51□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 WAR1YML076C 2835 nt1.51□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 POL5YEL055C 3069 nt1.5□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 snR55snR55 98 nt1.5□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.5□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 NUP157YER105C 4176 nt1.49□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.49□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 EAF1YDR359C 2949 nt1.49□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 RSM22YKL155C 1887 nt1.48□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.47□□□□□ -2.17
TMA17Q12513 OLI1Q0130 231 nt1.46□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 STB6YKL072W 2301 nt1.46□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 PAA1YDR071C 576 nt1.45□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 ECM12YHR021W-A 456 nt1.45□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 AHC1YOR023C 1701 nt1.44□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 HKR1YDR420W 5409 nt1.44□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 MEC1YBR136W 7107 nt1.44□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 COA6YMR244C-A 315 nt1.43□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 SGF11YPL047W 300 nt1.43□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 APL1YJR005W 2103 nt1.42□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.41□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 ABF2YMR072W 552 nt1.41□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 CDC39YCR093W 6327 nt1.41□□□□□ -2.18
TMA17Q12513 YDR366CYDR366C 399 nt1.4□□□□□ -2.19
TMA17Q12513 NOP9YJL010C 2001 nt1.4□□□□□ -2.19
TMA17Q12513 CCH1YGR217W 6120 nt1.39□□□□□ -2.19
TMA17Q12513 ISD11YER048W-A 285 nt1.38□□□□□ -2.19
TMA17Q12513 CMC4YMR194C-B 222 nt1.38□□□□□ -2.19
TMA17Q12513 YPL044CYPL044C 549 nt1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.8 ms