Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GTF2E1P29083 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2E1P29083 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms