Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXD3Q9UJU5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms