Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CGGBP1Q9UFW8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CGGBP1Q9UFW8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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