Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C1

ZMYND12, Zinc finger MYND domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND12Q9H0C1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZMYND12Q9H0C1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms