Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC82Q8N4S0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms