Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDE12Q6L8Q7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDE12Q6L8Q7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms