Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3C1V9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q3C1V9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q3C1V9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q3C1V9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q3C1V9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q3C1V9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3C1V9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3C1V9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3C1V9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3C1V9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3C1V9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms