Protein–RNA interactions for Protein: Q12504

RKM4, Ribosomal lysine N-methyltransferase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RKM4Q12504 SCD5YOR329C 2619 nt2.53□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 CSF1YLR087C 8877 nt2.52□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 YRB1YDR002W 606 nt2.52□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.52□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 RPS17AYML024W 411 nt2.52□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 SVL3YPL032C 2478 nt2.51□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.51□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 SPO75YLL005C 2607 nt2.51□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.5□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 YGL217CYGL217C 342 nt2.49□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 NOP14YDL148C 2433 nt2.49□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 TFC8YPL007C 1767 nt2.49□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 DNF1YER166W 4716 nt2.48□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 RAV1YJR033C 4074 nt2.48□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 GIP3YPL137C 3831 nt2.48□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 MSC6YOR354C 2079 nt2.48□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 TOF1YNL273W 3717 nt2.47□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 TIM9YEL020W-A 264 nt2.47□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.47□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 YOR170WYOR170W 306 nt2.47□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt2.47□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 ZIP1YDR285W 2628 nt2.47□□□□□ -2.01
RKM4Q12504 MCM10YIL150C 1716 nt2.46□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 RPL34BYIL052C 366 nt2.46□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.46□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 HSH155YMR288W 2916 nt2.46□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 MLH1YMR167W 2310 nt2.46□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 SPO21YOL091W 1830 nt2.45□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 RLM1YPL089C 2031 nt2.45□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 INO80YGL150C 4470 nt2.45□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 PUT3YKL015W 2940 nt2.45□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 TRL1YJL087C 2484 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 ATG11YPR049C 3537 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 DCP2YNL118C 2913 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 ECM12YHR021W-A 456 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 snR46snR46 197 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 YDR341CYDR341C 1824 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 TUS1YLR425W 3924 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 ENV11YGR071C 2583 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 ZIP2YGL249W 2115 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 SAP190YKR028W 3102 nt2.44□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.43□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 BRP1YGL007W 378 nt2.43□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 YJL120WYJL120W 324 nt2.43□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 CHC1YGL206C 4962 nt2.43□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 NAM7YMR080C 2916 nt2.43□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 SAS3YBL052C 2496 nt2.43□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 CAT2YML042W 2013 nt2.42□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 RAD34YDR314C 2079 nt2.42□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 RPS25BYLR333C 327 nt2.42□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.42□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 YBR174CYBR174C 315 nt2.42□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 UTP22YGR090W 3714 nt2.42□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 MAK10YEL053C 2202 nt2.41□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 RGA1YOR127W 3024 nt2.41□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 ULI1YFR026C 510 nt2.41□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 SPF1YEL031W 3648 nt2.41□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 TFC3YAL001C 3483 nt2.41□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 ELG1YOR144C 2376 nt2.41□□□□□ -2.02
RKM4Q12504 YNL170WYNL170W 396 nt2.4□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 snR52snR52 92 nt2.4□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 CDC60YPL160W 3273 nt2.4□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 BNI1YNL271C 5862 nt2.4□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.39□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 SYH1YPL105C 2550 nt2.39□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.39□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 NOC3YLR002C 1992 nt2.39□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 MAD1YGL086W 2250 nt2.39□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 MSH5YDL154W 2706 nt2.39□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 APL2YKL135C 2181 nt2.39□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 RTT107YHR154W 3213 nt2.38□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.38□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 YPR097WYPR097W 3222 nt2.37□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 RPL37BYDR500C 267 nt2.37□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 STH1YIL126W 4080 nt2.37□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 KOG1YHR186C 4674 nt2.37□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 REV3YPL167C 4515 nt2.37□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 SSD1YDR293C 3753 nt2.36□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 MLH3YPL164C 2148 nt2.36□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 RPL31AYDL075W 342 nt2.36□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 COF1YLL050C 432 nt2.36□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 SEC16YPL085W 6588 nt2.35□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 USO1YDL058W 5373 nt2.35□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 TOR2YKL203C 7425 nt2.35□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 LRE1YCL051W 1752 nt2.34□□□□□ -2.03
RKM4Q12504 PET309YLR067C 2898 nt2.34□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.33□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 YOR345CYOR345C 351 nt2.33□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 RTT101YJL047C 2529 nt2.33□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 UFD4YKL010C 4452 nt2.33□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 YOL098CYOL098C 3114 nt2.33□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 PAU3YCR104W 375 nt2.32□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 YIR044CYIR044C 186 nt2.32□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 YLL007CYLL007C 1998 nt2.32□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 YFR016CYFR016C 3702 nt2.32□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 CTR9YOL145C 3234 nt2.31□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 PIG1YLR273C 1947 nt2.31□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 AGC1YPR021C 2709 nt2.31□□□□□ -2.04
RKM4Q12504 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 67.7 ms