Protein–RNA interactions for Protein: Q12455

SPE4, Spermine synthase, yeastyeast

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE4Q12455 VPS15YBR097W 4365 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 RAD50YNL250W 3939 nt1.59□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 BPH1YCR032W 6504 nt1.59□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 TAR1YLR154W-C 375 nt1.59□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YOL160WYOL160W 342 nt1.59□□□□□ -2.15
SPE4Q12455 YLL054CYLL054C 2532 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YJL135WYJL135W 318 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YPL225WYPL225W 441 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 snR36snR36 182 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 MVP1YMR004W 1536 nt1.57□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 NCA2YPR155C 1851 nt1.57□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.57□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 SPO24YPR036W-A 204 nt1.57□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 UFD2YDL190C 2886 nt1.57□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 ENV11YGR071C 2583 nt1.57□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 NUP192YJL039C 5052 nt1.57□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.56□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 COA6YMR244C-A 315 nt1.56□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YOR376WYOR376W 369 nt1.56□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 MAD1YGL086W 2250 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 BST1YFL025C 3090 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YDR048CYDR048C 315 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 COF1YLL050C 432 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YLR140WYLR140W 327 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YAR029WYAR029W 225 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YSY6YBR162W-A 198 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 SMC4YLR086W 4257 nt1.54□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.54□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 TBS1YBR150C 3285 nt1.54□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YDR413CYDR413C 576 nt1.54□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 MON2YNL297C 4911 nt1.54□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 VPS54YDR027C 2670 nt1.53□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.53□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 SCW11YGL028C 1629 nt1.53□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 YJL022WYJL022W 309 nt1.53□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 AIM44YPL158C 2277 nt1.53□□□□□ -2.16
SPE4Q12455 SXM1YDR395W 2835 nt1.53□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 NHP2YDL208W 471 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 YFL032WYFL032W 321 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 YGL217CYGL217C 342 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 RPL39YJL189W 156 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 SLI15YBR156C 2097 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 BRR2YER172C 6492 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 TRM3YDL112W 4311 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 SLX4YLR135W 2247 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 CCH1YGR217W 6120 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 YDL211CYDL211C 1119 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 YGL149WYGL149W 306 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 YIR044CYIR044C 186 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 ALK1YGL021W 2283 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 CUL3YGR003W 2235 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 RAD34YDR314C 2079 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 MAM33YIL070C 801 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 YBR174CYBR174C 315 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 CAT8YMR280C 4302 nt1.49□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.49□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 YIL102CYIL102C 306 nt1.49□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 OST1YJL002C 1431 nt1.49□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 PMD1YER132C 5262 nt1.48□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 KCS1YDR017C 3153 nt1.48□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 YER097WYER097W 330 nt1.48□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 VPS55YJR044C 423 nt1.48□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 NUT1YGL151W 3399 nt1.47□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.47□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 YNL146WYNL146W 303 nt1.47□□□□□ -2.17
SPE4Q12455 MPT5YGL178W 2580 nt1.46□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 COG4YPR105C 2586 nt1.46□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 HTL1YCR020W-B 237 nt1.46□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 YJL015CYJL015C 285 nt1.46□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 PFD1YJL179W 330 nt1.46□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.46□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 PTP2YOR208W 2253 nt1.46□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 NIP100YPL174C 2607 nt1.46□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 LCD1YDR499W 2244 nt1.46□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 PKH2YOL100W 3246 nt1.45□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 STE5YDR103W 2754 nt1.45□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 CHS1YNL192W 3396 nt1.45□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 AZF1YOR113W 2745 nt1.45□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 YFL063WYFL063W 456 nt1.45□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 YPR063CYPR063C 423 nt1.45□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 DBP6YNR038W 1890 nt1.45□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 ADR1YDR216W 3972 nt1.45□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 SPC98YNL126W 2541 nt1.44□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 SSK2YNR031C 4740 nt1.44□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 MMS4YBR098W 2076 nt1.44□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 PET127YOR017W 2403 nt1.44□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 KAP122YGL016W 3246 nt1.43□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 RPL34BYIL052C 366 nt1.43□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.43□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 SPT21YMR179W 2277 nt1.43□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 EST2YLR318W 2655 nt1.43□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 HMRA2YCR096C 360 nt1.42□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 GPG1YGL121C 381 nt1.42□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 PBY1YBR094W 2262 nt1.42□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 PIP2YOR363C 2991 nt1.41□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 MSH3YCR092C 3057 nt1.41□□□□□ -2.18
SPE4Q12455 YLL007CYLL007C 1998 nt1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 78.8 ms