Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.16□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 MSH3YCR092C 3057 nt1.16□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 APL2YKL135C 2181 nt1.15□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 AIM44YPL158C 2277 nt1.15□□□□□ -2.22
RPN6Q12377 YER079WYER079W 633 nt1.15□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 UPS1YLR193C 528 nt1.15□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YOR053WYOR053W 342 nt1.15□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.15□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YBR285WYBR285W 435 nt1.15□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 SCW11YGL028C 1629 nt1.15□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YHL041WYHL041W 450 nt1.14□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.14□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YNL058CYNL058C 951 nt1.14□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YSY6YBR162W-A 198 nt1.14□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 LAA1YJL207C 6045 nt1.14□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 ZIP2YGL249W 2115 nt1.13□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.13□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 ENV11YGR071C 2583 nt1.13□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 NUT1YGL151W 3399 nt1.12□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 SPT21YMR179W 2277 nt1.12□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.12□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.12□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 snR51snR51 107 nt1.12□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 MPT5YGL178W 2580 nt1.12□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 MSN5YDR335W 3675 nt1.12□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 NPC2YDL046W 522 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 RRT15YLR162W-A 189 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 BSC3YLR465C 309 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 PIP2YOR363C 2991 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 LEE1YPL054W 906 nt1.11□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YHR138CYHR138C 345 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YLL020CYLL020C 306 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 RRT1YBL048W 312 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 snR14snR14 160 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YPR063CYPR063C 423 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 NUP188YML103C 4968 nt1.1□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 SLI15YBR156C 2097 nt1.09□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 APL1YJR005W 2103 nt1.09□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 SWI4YER111C 3282 nt1.09□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 SEC3YER008C 4011 nt1.09□□□□□ -2.23
RPN6Q12377 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.08□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 snR72snR72 98 nt1.08□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.08□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 NST1YNL091W 3723 nt1.07□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 INP2YMR163C 2118 nt1.07□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 PAC1YOR269W 1485 nt1.07□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YOR199WYOR199W 330 nt1.07□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YJR003CYJR003C 1560 nt1.07□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 VAM6YDL077C 3150 nt1.07□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 LCD1YDR499W 2244 nt1.07□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YDR157WYDR157W 402 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YJL135WYJL135W 318 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YOL160WYOL160W 342 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YPL261CYPL261C 309 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 FIG4YNL325C 2640 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 MMS4YBR098W 2076 nt1.06□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 SPO75YLL005C 2607 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 SIP4YJL089W 2490 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 ANS1YHR126C 480 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 RPL34BYIL052C 366 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 IRC23YOR044W 474 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YOR121CYOR121C 306 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 NUP145YGL092W 3954 nt1.05□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.04□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.04□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.04□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YBR012CYBR012C 420 nt1.04□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 COG4YPR105C 2586 nt1.04□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 SPT7YBR081C 3999 nt1.04□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 MDS3YGL197W 4464 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YCS4YLR272C 3531 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 ATG31YDR022C 591 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 RPL38YLR325C 237 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.03□□□□□ -2.24
RPN6Q12377 APL3YBL037W 3078 nt1.02□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.02□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.02□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 TRM732YMR259C 4263 nt1.02□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 RIM20YOR275C 1986 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 BUD3YCL014W 4911 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 PKH2YOL100W 3246 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 RPS20YHL015W 366 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 PCC1YKR095W-A 267 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 SET3YKR029C 2256 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 RAD34YDR314C 2079 nt1.01□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 STO1YMR125W 2586 nt1□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YDR426CYDR426C 378 nt1□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YFL019CYFL019C 354 nt1□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 GPG1YGL121C 381 nt1□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YIR044CYIR044C 186 nt1□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 ALY2YJL084C 3141 nt1□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 CUL3YGR003W 2235 nt1□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 PDE2YOR360C 1581 nt1□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YGR130CYGR130C 2451 nt0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 238.8 ms