Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 YPL225WYPL225W 441 nt1.35□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.35□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 SSK2YNR031C 4740 nt1.35□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 ZIP2YGL249W 2115 nt1.34□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 UFD2YDL190C 2886 nt1.34□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 RIM20YOR275C 1986 nt1.34□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.34□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 SDH2YLL041C 801 nt1.34□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YLR140WYLR140W 327 nt1.34□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 CFT1YDR301W 4074 nt1.33□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.33□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 TMA10YLR327C 261 nt1.33□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YOR376WYOR376W 369 nt1.33□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.33□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 SLX4YLR135W 2247 nt1.33□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 NCA2YPR155C 1851 nt1.33□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 MDS3YGL197W 4464 nt1.32□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 BST1YFL025C 3090 nt1.32□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 KAP122YGL016W 3246 nt1.32□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YDR102CYDR102C 333 nt1.32□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 VPS55YJR044C 423 nt1.32□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YOL160WYOL160W 342 nt1.32□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 NOC3YLR002C 1992 nt1.32□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 PCC1YKR095W-A 267 nt1.31□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 HTB2YBL002W 396 nt1.31□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 snR14snR14 160 nt1.31□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 PET127YOR017W 2403 nt1.3□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 SCW11YGL028C 1629 nt1.3□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 NPC2YDL046W 522 nt1.3□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YLR255CYLR255C 354 nt1.3□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.3□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 FYV8YGR196C 2454 nt1.3□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 GYP5YPL249C 2685 nt1.3□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 IRA1YBR140C 9279 nt1.29□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 MAD1YGL086W 2250 nt1.29□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 TRM732YMR259C 4263 nt1.29□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 FAB1YFR019W 6837 nt1.29□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 SEC21YNL287W 2808 nt1.29□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YDR048CYDR048C 315 nt1.28□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YAR029WYAR029W 225 nt1.28□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.28□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.28□□□□□ -2.2
TPT1Q12272 CCH1YGR217W 6120 nt1.28□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 NUT1YGL151W 3399 nt1.27□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 VPS54YDR027C 2670 nt1.27□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 RAD34YDR314C 2079 nt1.27□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 FIG2YCR089W 4830 nt1.27□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 SPC98YNL126W 2541 nt1.26□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 KIP1YBL063W 3336 nt1.26□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 NHP2YDL208W 471 nt1.26□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 MAM33YIL070C 801 nt1.26□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 TAR1YLR154W-C 375 nt1.26□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.26□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 PIK1YNL267W 3201 nt1.25□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 NIP100YPL174C 2607 nt1.25□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 snR36snR36 182 nt1.25□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YLL054CYLL054C 2532 nt1.25□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 NUP188YML103C 4968 nt1.24□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 SLI15YBR156C 2097 nt1.24□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YDL211CYDL211C 1119 nt1.24□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 LCD1YDR499W 2244 nt1.24□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 MEC1YBR136W 7107 nt1.24□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 EST2YLR318W 2655 nt1.23□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 COG4YPR105C 2586 nt1.23□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YJL015CYJL015C 285 nt1.23□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YJR011CYJR011C 786 nt1.23□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YKL118WYKL118W 312 nt1.23□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.23□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YSY6YBR162W-A 198 nt1.23□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 AZF1YOR113W 2745 nt1.22□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.22□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YDR413CYDR413C 576 nt1.22□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YFL032WYFL032W 321 nt1.22□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 YKL136WYKL136W 399 nt1.22□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 MPT5YGL178W 2580 nt1.22□□□□□ -2.21
TPT1Q12272 RSM22YKL155C 1887 nt1.21□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 YER097WYER097W 330 nt1.21□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 SPT21YMR179W 2277 nt1.2□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 SLD3YGL113W 2007 nt1.2□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 RPL34BYIL052C 366 nt1.2□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 MSN5YDR335W 3675 nt1.2□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 DBP6YNR038W 1890 nt1.2□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 PIP2YOR363C 2991 nt1.2□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 PKH2YOL100W 3246 nt1.19□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 PBY1YBR094W 2262 nt1.19□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 CDC36YDL165W 576 nt1.19□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.19□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 FIG4YNL325C 2640 nt1.19□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 BRR2YER172C 6492 nt1.19□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 YCK3YER123W 1575 nt1.18□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 OST1YJL002C 1431 nt1.18□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 SSS1YDR086C 243 nt1.18□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 YFL063WYFL063W 456 nt1.17□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 YLL020CYLL020C 306 nt1.17□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 RRT15YLR162W-A 189 nt1.17□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 SWI4YER111C 3282 nt1.17□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 AHC1YOR023C 1701 nt1.17□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 AIM44YPL158C 2277 nt1.17□□□□□ -2.22
TPT1Q12272 CUL3YGR003W 2235 nt1.16□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.3 ms