Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YPL150WYPL150W 2706 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 ATG26YLR189C 3597 nt2.8□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 APL1YJR005W 2103 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 NEW1YPL226W 3591 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 PHO91YNR013C 2685 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 TAO3YIL129C 7131 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 GCV2YMR189W 3105 nt2.79□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.78□□□□□ -1.96
TY1A-BLQ12266 BIR1YJR089W 2865 nt2.78□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 ENA5YDR038C 3276 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 VPS16YPL045W 2397 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 ACB1YGR037C 264 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 RPS22AYJL190C 393 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 ALK1YGL021W 2283 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 NOP14YDL148C 2433 nt2.77□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.76□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 MGM1YOR211C 2646 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 SPO14YKR031C 5052 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 ARO1YDR127W 4767 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 COG6YNL041C 2520 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 ENV11YGR071C 2583 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 MET6YER091C 2304 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 VTC3YPL019C 2508 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 BFR2YDR299W 1605 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 DCP2YNL118C 2913 nt2.75□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 ATG11YPR049C 3537 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 UBP1YDL122W 2430 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 APL2YKL135C 2181 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 BUD4YJR092W 4344 nt2.74□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 snR64snR64 101 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 NMD2YHR077C 3270 nt2.73□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 SNQ2YDR011W 4506 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 KAP120YPL125W 3099 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 snR50snR50 90 nt2.72□□□□□ -1.97
TY1A-BLQ12266 TAH1YCR060W 336 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 GLG1YKR058W 1851 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 PMR1YGL167C 2853 nt2.71□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 SEC1YDR164C 2175 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 FLO5YHR211W 3228 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 UBP15YMR304W 3693 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 RPS26AYGL189C 360 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 IKI3YLR384C 4050 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 YDR210WYDR210W 228 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 RPL37BYDR500C 267 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 NET1YJL076W 3570 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 MDM1YML104C 3384 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 FLO1YAR050W 4614 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 DSE4YNR067C 3354 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 TFC4YGR047C 3078 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 SDC25YLL016W 3147 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 RGR1YLR071C 3249 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 CDC53YDL132W 2448 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 PAU11YGL261C 363 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 SGM1YJR134C 2124 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 PKH2YOL100W 3246 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 COG4YPR105C 2586 nt2.65□□□□□ -1.98
TY1A-BLQ12266 snR75snR75 89 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 PAU10YDR542W 363 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 PAU4YLR461W 363 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 snR47snR47 99 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 RTT107YHR154W 3213 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 STE6YKL209C 3873 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 MOT1YPL082C 5604 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 SMC2YFR031C 3513 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 YGR067CYGR067C 2415 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 DBP10YDL031W 2988 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 EAF1YDR359C 2949 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 BPT1YLL015W 4680 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 PSK1YAL017W 4071 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 DYN1YKR054C 12279 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 ESL1YIL151C 3357 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 ISW1YBR245C 3390 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 MMS22YLR320W 4365 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 MAK10YEL053C 2202 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 YLR232WYLR232W 348 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 IST2YBR086C 2841 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 SEC7YDR170C 6030 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 MLH3YPL164C 2148 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 MDS3YGL197W 4464 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 YLR278CYLR278C 4026 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 UFD2YDL190C 2886 nt2.6□□□□□ -1.99
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