Protein–RNA interactions for Protein: Q08054

CSI2, Chitin synthase 3 complex protein CSI2, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2Q08054 VPS54YDR027C 2670 nt0.77□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YLL032CYLL032C 2478 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 RFX1YLR176C 2436 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 OST1YJL002C 1431 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YIL059CYIL059C 366 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 INA22YIR024C 651 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 NUT2YPR168W 474 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 SAS3YBL052C 2496 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 EFR3YMR212C 2349 nt0.76□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 DIE2YGR227W 1578 nt0.75□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YDR269CYDR269C 324 nt0.75□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 CYC7YEL039C 342 nt0.75□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YLR456WYLR456W 615 nt0.75□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YDL011CYDL011C 324 nt0.74□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 CBS1YDL069C 690 nt0.74□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.74□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 MRPL31YKL138C 396 nt0.74□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 SDH2YLL041C 801 nt0.74□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.74□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YAR009CYAR009C 3591 nt0.74□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 SLY1YDR189W 2001 nt0.74□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.73□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 UBC7YMR022W 498 nt0.73□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 Q0017Q0017 162 nt0.73□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 SCW11YGL028C 1629 nt0.73□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 SPT21YMR179W 2277 nt0.73□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YLR202CYLR202C 327 nt0.72□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.72□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 PAU24YBR301W 363 nt0.72□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 MPT5YGL178W 2580 nt0.72□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 NUT1YGL151W 3399 nt0.72□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 SWI4YER111C 3282 nt0.72□□□□□ -2.29
CSI2Q08054 ENV11YGR071C 2583 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 UPS1YLR193C 528 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 AIM44YPL158C 2277 nt0.71□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YJR003CYJR003C 1560 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 UBP3YER151C 2739 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 AIM9YER080W 1884 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 SDH7YDR511W 402 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YJL007CYJL007C 315 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YKL083WYKL083W 615 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 RPB10YOR210W 213 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YPL068CYPL068C 882 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 IFH1YLR223C 3258 nt0.7□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 APL3YBL037W 3078 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 ZIP2YGL249W 2115 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YKL202WYKL202W 582 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YAR047CYAR047C 321 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 RPL26AYLR344W 384 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 MRPL50YNR022C 420 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 FIG4YNL325C 2640 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 PCF11YDR228C 1881 nt0.69□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 LCD1YDR499W 2244 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 NPC2YDL046W 522 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YAP6YDR259C 1152 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 PAU12YGR294W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YHL041WYHL041W 450 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 KAP120YPL125W 3099 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YPL229WYPL229W 621 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.68□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 STB6YKL072W 2301 nt0.67□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 snR72snR72 98 nt0.67□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 RPS24BYIL069C 408 nt0.67□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 RRT1YBL048W 312 nt0.67□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YBR012CYBR012C 420 nt0.67□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YPL205CYPL205C 345 nt0.67□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 SLI15YBR156C 2097 nt0.67□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 CDC39YCR093W 6327 nt0.67□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 SET3YKR029C 2256 nt0.67□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 SLD3YGL113W 2007 nt0.66□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.66□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 ISF1YMR081C 1017 nt0.66□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 snR51snR51 107 nt0.66□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 STO1YMR125W 2586 nt0.66□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 SEC1YDR164C 2175 nt0.66□□□□□ -2.3
CSI2Q08054 YJL135WYJL135W 318 nt0.65□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.65□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YOR199WYOR199W 330 nt0.65□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 MMS4YBR098W 2076 nt0.65□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 Q0144Q0144 330 nt0.64□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.64□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 QCR9YGR183C 201 nt0.64□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YJR157WYJR157W 363 nt0.64□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YLR434CYLR434C 384 nt0.64□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 IRC23YOR044W 474 nt0.64□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.64□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.64□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 PDE2YOR360C 1581 nt0.63□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YKL063CYKL063C 504 nt0.63□□□□□ -2.31
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