Protein–RNA interactions for Protein: Q03390

VPS60, Vacuolar protein-sorting-associated protein 60, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS60Q03390 CYC7YEL039C 342 nt0.99□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.99□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 YLR287CYLR287C 1068 nt0.99□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 ATP19YOL077W-A 207 nt0.99□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 SCW11YGL028C 1629 nt0.99□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 SLY1YDR189W 2001 nt0.99□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 EFR3YMR212C 2349 nt0.99□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 SEC3YER008C 4011 nt0.99□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 NUP145YGL092W 3954 nt0.98□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 APL3YBL037W 3078 nt0.98□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 WIP1YDR374W-A 270 nt0.98□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 YLR101CYLR101C 396 nt0.98□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 UPS1YLR193C 528 nt0.98□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.98□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 DIE2YGR227W 1578 nt0.98□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 EAF1YDR359C 2949 nt0.98□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 CDC39YCR093W 6327 nt0.97□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 YDL011CYDL011C 324 nt0.97□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 PAU24YBR301W 363 nt0.97□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 YJR029WYJR029W 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
VPS60Q03390 HCH1YNL281W 462 nt0.96□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 STB6YKL072W 2301 nt0.96□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 YAR009CYAR009C 3591 nt0.96□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 AIM44YPL158C 2277 nt0.95□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 YBR012CYBR012C 420 nt0.95□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 CBS1YDL069C 690 nt0.94□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.94□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 YKL202WYKL202W 582 nt0.94□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 IFH1YLR223C 3258 nt0.93□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.93□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.93□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 SET3YKR029C 2256 nt0.92□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 NPC2YDL046W 522 nt0.92□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 RRT1YBL048W 312 nt0.92□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 ZIP2YGL249W 2115 nt0.92□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 LCD1YDR499W 2244 nt0.92□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 ALY2YJL084C 3141 nt0.91□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 FIG4YNL325C 2640 nt0.91□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 AIM9YER080W 1884 nt0.91□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 UBC7YMR022W 498 nt0.91□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 SLI15YBR156C 2097 nt0.9□□□□□ -2.26
VPS60Q03390 STO1YMR125W 2586 nt0.9□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 RPB10YOR210W 213 nt0.9□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 SLD3YGL113W 2007 nt0.89□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 MMS4YBR098W 2076 nt0.89□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YLR456WYLR456W 615 nt0.89□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.89□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YPL229WYPL229W 621 nt0.89□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.89□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YJR003CYJR003C 1560 nt0.88□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 PDE2YOR360C 1581 nt0.88□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 SDH7YDR511W 402 nt0.88□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 MRPL50YNR022C 420 nt0.88□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 Q0017Q0017 162 nt0.88□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YJL135WYJL135W 318 nt0.87□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YAR047CYAR047C 321 nt0.87□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YAP6YDR259C 1152 nt0.86□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YKL083WYKL083W 615 nt0.86□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 snR51snR51 107 nt0.86□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 NUP157YER105C 4176 nt0.85□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 STF2YGR008C 255 nt0.85□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YHL041WYHL041W 450 nt0.85□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YJL007CYJL007C 315 nt0.85□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 PAM16YJL104W 450 nt0.85□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 RPL26AYLR344W 384 nt0.85□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YOL160WYOL160W 342 nt0.85□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YOR199WYOR199W 330 nt0.85□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 snR72snR72 98 nt0.84□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 RPS24BYIL069C 408 nt0.84□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.84□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 IRC23YOR044W 474 nt0.84□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 YPL261CYPL261C 309 nt0.84□□□□□ -2.27
VPS60Q03390 PCF11YDR228C 1881 nt0.84□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YPR117WYPR117W 7470 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 ISF1YMR081C 1017 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YDL206WYDL206W 2289 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 KAP120YPL125W 3099 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 SEC1YDR164C 2175 nt0.83□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.82□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YNL058CYNL058C 951 nt0.82□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 GPG1YGL121C 381 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YOR029WYOR029W 336 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YPL205CYPL205C 345 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 UTP20YBL004W 7482 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 RIM20YOR275C 1986 nt0.81□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 RAD34YDR314C 2079 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 INP2YMR163C 2118 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YKL063CYKL063C 504 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 HUG1YML058W-A 207 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 WAR1YML076C 2835 nt0.8□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 PKH2YOL100W 3246 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 NHP2YDL208W 471 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YGR042WYGR042W 816 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YLR202CYLR202C 327 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 PAN2YGL094C 3348 nt0.79□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YPL068CYPL068C 882 nt0.78□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YPL185WYPL185W 396 nt0.78□□□□□ -2.28
VPS60Q03390 YDR521WYDR521W 336 nt0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1230.2 ms