Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COPB1P53618 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
COPB1P53618 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COPB1P53618 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COPB1P53618 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COPB1P53618 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COPB1P53618 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms