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Protein–RNA interactions for Protein: P53389
HOL1, Protein HOL1, yeast
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586 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
HOL1
P53389
HMRA2
YCR096C
360 nt
1.95
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
YHL042W
YHL042W
453 nt
1.95
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
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YPL152W-A
99 nt
1.95
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
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YLR419W
4308 nt
1.95
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
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YFR016C
3702 nt
1.94
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
NEO1
YIL048W
3456 nt
1.94
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
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YFR019W
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1.94
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
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YBL052C
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□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
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YML071C
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□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
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YPL249C
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□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
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HOL1
P53389
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HOL1
P53389
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YGR069W
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HOL1
P53389
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YHR063W-A
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□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
TFC3
YAL001C
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HOL1
P53389
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YGL249W
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HOL1
P53389
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□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
RAD61
YDR014W
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□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
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YLL041C
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□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
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YMR247W-A
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□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
LCD1
YDR499W
2244 nt
1.92
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
SPP41
YDR464W
4308 nt
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□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
snR60
snR60
104 nt
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□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
YOR108C-A
YOR108C-A
210 nt
1.91
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
KCS1
YDR017C
3153 nt
1.91
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
FRK1
YPL141C
2598 nt
1.91
□□□□□ -2.1
HOL1
P53389
YEL020C-B
YEL020C-B
198 nt
1.9
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
PAU2
YEL049W
363 nt
1.9
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
tT(UGU)H
tT(UGU)H
72 nt
1.9
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
SFB2
YNL049C
2631 nt
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□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
RAD34
YDR314C
2079 nt
1.9
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
YDL211C
YDL211C
1119 nt
1.89
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
YDR366C
YDR366C
399 nt
1.89
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
INA22
YIR024C
651 nt
1.89
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
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YJL052C-A
120 nt
1.89
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
YBL012C
YBL012C
402 nt
1.89
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
LRE1
YCL051W
1752 nt
1.89
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
MAD1
YGL086W
2250 nt
1.89
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
YHR214C-B
YHR214C-B
5382 nt
1.89
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
SPT21
YMR179W
2277 nt
1.88
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
UTP21
YLR409C
2820 nt
1.88
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
GCN2
YDR283C
4980 nt
1.88
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
snR8
snR8
190 nt
1.88
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
BRE1
YDL074C
2103 nt
1.88
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
SPO75
YLL005C
2607 nt
1.87
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
SKI3
YPR189W
4299 nt
1.87
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
YCK3
YER123W
1575 nt
1.87
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
YJL015C
YJL015C
285 nt
1.87
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
YMR175W-A
YMR175W-A
195 nt
1.87
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
YOR008C-A
YOR008C-A
225 nt
1.87
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
KIP1
YBL063W
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HOL1
P53389
AI5_ALPHA
Q0070
1893 nt
1.86
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
UBP2
YOR124C
3819 nt
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□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
YOR019W
YOR019W
2193 nt
1.85
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
MON2
YNL297C
4911 nt
1.85
□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
NUT1
YGL151W
3399 nt
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□□□□□ -2.11
HOL1
P53389
VIK1
YPL253C
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HOL1
P53389
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YER172C-A
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HOL1
P53389
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YIL052C
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HOL1
P53389
NOC3
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HOL1
P53389
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HOL1
P53389
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HOL1
P53389
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HOL1
P53389
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YHR210C
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HOL1
P53389
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YIL027C
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HOL1
P53389
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YNR010W
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HOL1
P53389
PEP1
YBL017C
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HOL1
P53389
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□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
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YNL028W
318 nt
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□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
CTF4
YPR135W
2784 nt
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□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
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YMR230W-A
189 nt
1.81
□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
YOR015W
YOR015W
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1.81
□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
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□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
YCS4
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□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
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YIR044C
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□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
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YBL008W-A
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HOL1
P53389
DGR1
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HOL1
P53389
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YJL120W
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HOL1
P53389
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1.79
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HOL1
P53389
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YMR172C-A
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HOL1
P53389
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YBR064W
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□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
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YLR035C-A
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HOL1
P53389
KAP122
YGL016W
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HOL1
P53389
VPS54
YDR027C
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1.78
□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
YJL022W
YJL022W
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1.78
□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
snR49
snR49
165 nt
1.78
□□□□□ -2.12
HOL1
P53389
YMR158W-B
YMR158W-B
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□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
SPO21
YOL091W
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1.77
□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
YGR109W-B
YGR109W-B
4644 nt
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□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
UFD2
YDL190C
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□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
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YGL188C-A
141 nt
1.76
□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
YJL197C-A
YJL197C-A
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1.76
□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
COF1
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HOL1
P53389
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YLR333C
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1.76
□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
YMR321C
YMR321C
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1.76
□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
COG4
YPR105C
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1.76
□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
SLI15
YBR156C
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1.76
□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
ALK1
YGL021W
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1.75
□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
YGL052W
YGL052W
306 nt
1.75
□□□□□ -2.13
HOL1
P53389
PDE2
YOR360C
1581 nt
1.75
□□□□□ -2.13
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