Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	VPS55	YJR044C	423 nt		1.19	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	PAU18	YLL064C	363 nt		1.19	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	PAU6	YNR076W	363 nt		1.19	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YOR376W	YOR376W	369 nt		1.19	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	SRP14	YDL092W	441 nt		1.18	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YKL083W	YKL083W	615 nt		1.18	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	UFD2	YDL190C	2886 nt		1.18	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	MVP1	YMR004W	1536 nt		1.18	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	PBY1	YBR094W	2262 nt		1.18	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	PAC1	YOR269W	1485 nt		1.18	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	AZF1	YOR113W	2745 nt		1.17	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	SMC4	YLR086W	4257 nt		1.17	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YLL054C	YLL054C	2532 nt		1.17	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	CSN9	YDR179C	489 nt		1.17	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	MRPL31	YKL138C	396 nt		1.17	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	RPL9B	YNL067W	576 nt		1.17	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YAF9	YNL107W	681 nt		1.17	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YPR197C	YPR197C	564 nt		1.17	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	SPT7	YBR081C	3999 nt		1.17	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	UBP3	YER151C	2739 nt		1.17	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	DGR2	YKL121W	2559 nt		1.16	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	KAP122	YGL016W	3246 nt		1.16	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	MSN5	YDR335W	3675 nt		1.16	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	TIM13	YGR181W	318 nt		1.16	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	RPS20	YHL015W	366 nt		1.16	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	PXA2	YKL188C	2562 nt		1.15	□□□□□ -2.22
ATG12	P38316	YDR008C	YDR008C	351 nt		1.15	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	CYC7	YEL039C	342 nt		1.15	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YGR035C	YGR035C	351 nt		1.15	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YIL020C-A	YIL020C-A	339 nt		1.15	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YAR053W	YAR053W	297 nt		1.15	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YNL058C	YNL058C	951 nt		1.15	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	IRC23	YOR044W	474 nt		1.15	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	TIM18	YOR297C	579 nt		1.15	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	MUK1	YPL070W	1839 nt		1.15	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	SGO1	YOR073W	1773 nt		1.14	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	SWI6	YLR182W	2412 nt		1.14	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YOR161W-B	YOR161W-B	261 nt		1.14	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	RAD50	YNL250W	3939 nt		1.14	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YIL059C	YIL059C	366 nt		1.13	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YJL135W	YJL135W	318 nt		1.13	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	RPL40B	YKR094C	387 nt		1.13	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YLR146W-A	YLR146W-A	189 nt		1.13	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YPL182C	YPL182C	384 nt		1.13	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	RSM22	YKL155C	1887 nt		1.13	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	SEC3	YER008C	4011 nt		1.13	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	VPS54	YDR027C	2670 nt		1.12	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YDR003W-A	YDR003W-A	123 nt		1.12	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	RTR1	YER139C	681 nt		1.12	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	RRT15	YLR162W-A	189 nt		1.12	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	UPS1	YLR193C	528 nt		1.12	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YOR072W-A	YOR072W-A	249 nt		1.12	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YJR003C	YJR003C	1560 nt		1.12	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	CDC36	YDL165W	576 nt		1.11	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	NHP2	YDL208W	471 nt		1.11	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	PAU2	YEL049W	363 nt		1.11	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YOP1	YPR028W	543 nt		1.11	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	SLX4	YLR135W	2247 nt		1.1	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YDL211C	YDL211C	1119 nt		1.1	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YSY6	YBR162W-A	198 nt		1.1	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	AIM9	YER080W	1884 nt		1.09	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	BEM2	YER155C	6504 nt		1.09	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	NOC3	YLR002C	1992 nt		1.09	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	RPL35A	YDL191W	363 nt		1.09	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YGL217C	YGL217C	342 nt		1.09	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YGR174W-A	YGR174W-A	87 nt		1.09	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	YHL046W-A	YHL046W-A	327 nt		1.09	□□□□□ -2.23
ATG12	P38316	RAD9	YDR217C	3930 nt		1.09	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	snR72	snR72	98 nt		1.08	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YDR102C	YDR102C	333 nt		1.08	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YPL229W	YPL229W	621 nt		1.08	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YCS4	YLR272C	3531 nt		1.07	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YJR029W	YJR029W	5268 nt		1.07	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YPR137C-B	YPR137C-B	5268 nt		1.07	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YDL240C-A	YDL240C-A	138 nt		1.07	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	RPS27A	YKL156W	249 nt		1.07	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YMR242W-A	YMR242W-A	90 nt		1.07	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	RPS30B	YOR182C	192 nt		1.07	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YPR063C	YPR063C	423 nt		1.07	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	NUT2	YPR168W	474 nt		1.07	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	LYS14	YDR034C	2373 nt		1.07	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	AIM44	YPL158C	2277 nt		1.06	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	BUD3	YCL014W	4911 nt		1.06	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YJR011C	YJR011C	786 nt		1.06	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	BIL1	YOR304C-A	231 nt		1.06	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	PIG1	YLR273C	1947 nt		1.06	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	SLY1	YDR189W	2001 nt		1.06	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	SAS3	YBL052C	2496 nt		1.05	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YDR182W-A	YDR182W-A	204 nt		1.05	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	snR51	snR51	107 nt		1.05	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YDR048C	YDR048C	315 nt		1.04	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YDR413C	YDR413C	576 nt		1.04	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YFL032W	YFL032W	321 nt		1.04	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	PAM16	YJL104W	450 nt		1.04	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YPR010C-A	YPR010C-A	219 nt		1.04	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	snR36	snR36	182 nt		1.04	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	NUP145	YGL092W	3954 nt		1.03	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	SWI4	YER111C	3282 nt		1.03	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YER097W	YER097W	330 nt		1.03	□□□□□ -2.24
ATG12	P38316	YHR007C-A	YHR007C-A	216 nt		1.03	□□□□□ -2.24

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