Protein–RNA interactions for Protein: P0CX14

YRF1-3, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-3P0CX14 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 YHR054CYHR054C 1065 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 RPC10YHR143W-A 213 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 GMC2YLR445W 567 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 COX7YMR256C 183 nt0.12□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 TFB6YOR352W 1032 nt0.11□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 VIK1YPL253C 1944 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 MYO1YHR023W 5787 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 snR84snR84 550 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 TIM8YJR135W-A 264 nt0.1□□□□□ -2.39
YRF1-3P0CX14 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.09□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 RPL26BYGR034W 384 nt0.09□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 PET111YMR257C 2403 nt0.08□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YOR248WYOR248W 303 nt0.08□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 PAN3YKL025C 2040 nt0.08□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 NOP9YJL010C 2001 nt0.08□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 PMP1YCR024C-A 123 nt0.07□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 BIG1YHR101C 1008 nt0.07□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 PRP21YJL203W 843 nt0.07□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 AFR1YDR085C 1863 nt0.07□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 TDA2YER071C 381 nt0.07□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.07□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YLR271WYLR271W 825 nt0.07□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YLL032CYLL032C 2478 nt0.06□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 HTB1YDR224C 396 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 RSM27YGR215W 333 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 MRPL50YNR022C 420 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 VAM3YOR106W 852 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YBR064WYBR064W 429 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 RSM23YGL129C 1353 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 VMA21YGR105W 234 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YPR170CYPR170C 336 nt0.05□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.04□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 TIM10YHR005C-A 282 nt0.03□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YLR252WYLR252W 306 nt0.03□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YOR364WYOR364W 369 nt0.03□□□□□ -2.4
YRF1-3P0CX14 YKL111CYKL111C 336 nt0.03□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YLR217WYLR217W 324 nt0.03□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YPR096CYPR096C 303 nt0.03□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YHL042WYHL042W 453 nt0.02□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 RPB10YOR210W 213 nt0.02□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 RPL35AYDL191W 363 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YBL062WYBL062W 381 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 LEE1YPL054W 906 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YPR153WYPR153W 423 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 SBH1YER087C-B 249 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YOL160WYOL160W 342 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 RCN2YOR220W 798 nt0.01□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 snR5snR5 204 nt0□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YGR115CYGR115C 780 nt0□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YJR079WYJR079W 330 nt0□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YNL050CYNL050C 813 nt0□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 RFX1YLR176C 2436 nt-0.01□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 QCR7YDR529C 384 nt-0.02□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YDR220CYDR220C 294 nt-0.03□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 INP2YMR163C 2118 nt-0.03□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YJL135WYJL135W 318 nt-0.03□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YPL044CYPL044C 549 nt-0.03□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 YCL002CYCL002C 792 nt-0.03□□□□□ -2.41
YRF1-3P0CX14 OLI1Q0130 231 nt-0.04□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 CWC23YGL128C 852 nt-0.04□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.04□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YJL007CYJL007C 315 nt-0.04□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 CSM4YPL200W 471 nt-0.04□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 FYV10YIL097W 1551 nt-0.04□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 AFB1YLR040C 675 nt-0.05□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YBR071WYBR071W 636 nt-0.05□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 IRC16YPR038W 360 nt-0.05□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 NPC2YDL046W 522 nt-0.05□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.05□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.05□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 snR190snR190 190 nt-0.05□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 BUD26YDR241W 288 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 MRPL31YKL138C 396 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 RPL26AYLR344W 384 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 BSC3YLR465C 309 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 CDC33YOL139C 642 nt-0.06□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YGR164WYGR164W 336 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 PRP42YDR235W 1635 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 SSS1YDR086C 243 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 HUR1YGL168W 333 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 COX12YLR038C 252 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.07□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 RCO1YMR075W 2055 nt-0.08□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 CUL3YGR003W 2235 nt-0.08□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 ILM1YJR118C 612 nt-0.08□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 SDS22YKL193C 1017 nt-0.09□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 YDL187CYDL187C 330 nt-0.1□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.1□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 DCP1YOL149W 696 nt-0.1□□□□□ -2.42
YRF1-3P0CX14 snR46snR46 197 nt-0.1□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 134.9 ms