Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAD1O00515 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAD1O00515 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAD1O00515 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAD1O00515 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms