Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
BHMG1C9JSJ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms