Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3C1V9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q3C1V9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q3C1V9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q3C1V9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q3C1V9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q3C1V9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q3C1V9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q3C1V9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q3C1V9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q3C1V9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3C1V9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3C1V9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3C1V9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3C1V9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms