Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTP4A2Q12974 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTP4A2Q12974 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTP4A2Q12974 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTP4A2Q12974 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTP4A2Q12974 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTP4A2Q12974 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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PTP4A2Q12974 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTP4A2Q12974 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTP4A2Q12974 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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