Protein–RNA interactions for Protein: Q12400

TRM10, tRNA (guanine(9)-N1)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10Q12400 ZIP1YDR285W 2628 nt1.23□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 BST1YFL025C 3090 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 SPO23YBR250W 1572 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 YDL011CYDL011C 324 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 YDR114CYDR114C 303 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 YGR042WYGR042W 816 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 TIM13YGR181W 318 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 COF1YLL050C 432 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 YLR140WYLR140W 327 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 MRPL50YNR022C 420 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 ADR1YDR216W 3972 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 SEC21YNL287W 2808 nt1.22□□□□□ -2.21
TRM10Q12400 LYS14YDR034C 2373 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 ALK1YGL021W 2283 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YEL057CYEL057C 702 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 RPS24BYIL069C 408 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 RPS27AYKL156W 249 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 MLH3YPL164C 2148 nt1.21□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 SWI6YLR182W 2412 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 CDC36YDL165W 576 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 PAU2YEL049W 363 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 PRE4YFR050C 801 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 VAR1Q0140 1197 nt1.2□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 RAD50YNL250W 3939 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 CYC7YEL039C 342 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YAR047CYAR047C 321 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 RPL26AYLR344W 384 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 MVP1YMR004W 1536 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 SEC5YDR166C 2916 nt1.19□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 SWF1YDR126W 1011 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 RTR1YER139C 681 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 DGR2YKL121W 2559 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 PCF11YDR228C 1881 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 NCA2YPR155C 1851 nt1.18□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YAP6YDR259C 1152 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YDR269CYDR269C 324 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YER079WYER079W 633 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 AGA2YGL032C 264 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YHL037CYHL037C 402 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YJL015CYJL015C 285 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YLR434CYLR434C 384 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 RPL33BYOR234C 324 nt1.17□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 MDS3YGL197W 4464 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 RFX1YLR176C 2436 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 UFD2YDL190C 2886 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 EMC5YIL027C 426 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YIL059CYIL059C 366 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 HIT1YJR055W 495 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YKL083WYKL083W 615 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 RPL40BYKR094C 387 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 RPL9BYNL067W 576 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YOL159CYOL159C 516 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 CDC31YOR257W 486 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YOR376WYOR376W 369 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YPL185WYPL185W 396 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 EFR3YMR212C 2349 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.16□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 KAP122YGL016W 3246 nt1.15□□□□□ -2.22
TRM10Q12400 YGL217CYGL217C 342 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 VPS55YJR044C 423 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 MRPL31YKL138C 396 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 ISF1YMR081C 1017 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 YBR285WYBR285W 435 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 AIM9YER080W 1884 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 YLL032CYLL032C 2478 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 SLX4YLR135W 2247 nt1.15□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 YHL041WYHL041W 450 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 YLR255CYLR255C 354 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 TIM18YOR297C 579 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 LEE1YPL054W 906 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 PIG1YLR273C 1947 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 MSH3YCR092C 3057 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 RSM22YKL155C 1887 nt1.14□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 NUP192YJL039C 5052 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 TRM732YMR259C 4263 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 snR14snR14 160 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 YPL229WYPL229W 621 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 NUT2YPR168W 474 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 SGO1YOR073W 1773 nt1.13□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 UPS1YLR193C 528 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 YML003WYML003W 873 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 RRT1YBL048W 312 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 RAD9YDR217C 3930 nt1.12□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 NUP188YML103C 4968 nt1.11□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 SAS3YBL052C 2496 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 SLY1YDR189W 2001 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 EST2YLR318W 2655 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.1□□□□□ -2.23
TRM10Q12400 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.7 ms