Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 HTB2YBL002W 396 nt1.71□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.71□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 NUP120YKL057C 3114 nt1.71□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 CTF4YPR135W 2784 nt1.7□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YIL059CYIL059C 366 nt1.7□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YBL083CYBL083C 426 nt1.7□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 MNL2YLR057W 2550 nt1.7□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 snR8snR8 190 nt1.69□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 RPL42BYHR141C 321 nt1.69□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.69□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 RPL42AYNL162W 321 nt1.69□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 CDC53YDL132W 2448 nt1.69□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 IRA1YBR140C 9279 nt1.69□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 TRL1YJL087C 2484 nt1.68□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 HER1YOR227W 3741 nt1.68□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 OSH6YKR003W 1347 nt1.68□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 CHC1YGL206C 4962 nt1.68□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 HMRA2YCR096C 360 nt1.68□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 TMA7YLR262C-A 195 nt1.68□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 HDA3YPR179C 1968 nt1.68□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 MEC1YBR136W 7107 nt1.67□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 MYO4YAL029C 4416 nt1.67□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 PDR8YLR266C 2106 nt1.67□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 GRR1YJR090C 3456 nt1.67□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 snR51snR51 107 nt1.67□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 MET18YIL128W 3099 nt1.67□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.67□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.66□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 HOP2YGL033W 657 nt1.66□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.66□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.66□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 HHT1YBR010W 411 nt1.66□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YOR333CYOR333C 417 nt1.66□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 NOP53YPL146C 1368 nt1.66□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 DBP6YNR038W 1890 nt1.66□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 YNL144CYNL144C 2223 nt1.66□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 SLM1YIL105C 2061 nt1.65□□□□□ -2.14
HRT3Q12347 ATG9YDL149W 2994 nt1.65□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 UPS1YLR193C 528 nt1.65□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.65□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 CDC31YOR257W 486 nt1.65□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 SBE22YHR103W 2559 nt1.65□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 EFR3YMR212C 2349 nt1.65□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 HTL1YCR020W-B 237 nt1.64□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YDR286CYDR286C 345 nt1.64□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 CYC7YEL039C 342 nt1.64□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YNL114CYNL114C 372 nt1.64□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YOP1YPR028W 543 nt1.64□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 NUT2YPR168W 474 nt1.64□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 RIM20YOR275C 1986 nt1.64□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 MGA2YIR033W 3342 nt1.64□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 OST1YJL002C 1431 nt1.64□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 PXA2YKL188C 2562 nt1.63□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 VPS15YBR097W 4365 nt1.63□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YGR069WYGR069W 336 nt1.63□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.63□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 BUD2YKL092C 3315 nt1.63□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 MNE1YOR350C 1992 nt1.62□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 SWI5YDR146C 2130 nt1.62□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YDR426CYDR426C 378 nt1.62□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YIL102CYIL102C 306 nt1.62□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YJL015CYJL015C 285 nt1.62□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YLR053CYLR053C 327 nt1.62□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.62□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.62□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 CAT2YML042W 2013 nt1.62□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 HSL1YKL101W 4557 nt1.61□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YCR043CYCR043C 384 nt1.61□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 NPC2YDL046W 522 nt1.61□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YDR344CYDR344C 444 nt1.61□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YIL032CYIL032C 357 nt1.61□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 RPL38YLR325C 237 nt1.61□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.61□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 BRR2YER172C 6492 nt1.6□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 CFT2YLR115W 2580 nt1.6□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 CAT8YMR280C 4302 nt1.6□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 LHS1YKL073W 2646 nt1.6□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 SEY1YOR165W 2331 nt1.6□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YDL062WYDL062W 426 nt1.6□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 RPL37BYDR500C 267 nt1.6□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.6□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 PCC1YKR095W-A 267 nt1.6□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 RPH1YER169W 2391 nt1.6□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 SWI6YLR182W 2412 nt1.59□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 BPH1YCR032W 6504 nt1.59□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 PFD1YJL179W 330 nt1.59□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 MCM22YJR135C 720 nt1.59□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 PAU18YLL064C 363 nt1.59□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 PAU6YNR076W 363 nt1.59□□□□□ -2.15
HRT3Q12347 MVP1YMR004W 1536 nt1.59□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 ZRG8YER033C 3231 nt1.59□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 CHS1YNL192W 3396 nt1.58□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 DCP2YNL118C 2913 nt1.58□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 ALG13YGL047W 609 nt1.58□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YJL135WYJL135W 318 nt1.58□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.58□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YCL046WYCL046W 324 nt1.58□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 YDR341CYDR341C 1824 nt1.58□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 RAD61YDR014W 1944 nt1.58□□□□□ -2.16
HRT3Q12347 snR60snR60 104 nt1.57□□□□□ -2.16
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