Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 SLN1YIL147C 3663 nt1.51□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 TBS1YBR150C 3285 nt1.51□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 NAB6YML117W 3405 nt1.5□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 PDR3YBL005W 2931 nt1.5□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 DCP2YNL118C 2913 nt1.5□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.5□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YIL059CYIL059C 366 nt1.5□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 TRX1YLR043C 312 nt1.5□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.5□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 ZIP1YDR285W 2628 nt1.5□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YEL057CYEL057C 702 nt1.49□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.49□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 UPS1YLR193C 528 nt1.49□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YAR053WYAR053W 297 nt1.49□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 HMI1YOL095C 2121 nt1.49□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 NUP170YBL079W 4509 nt1.49□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 APL5YPL195W 2799 nt1.48□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 RFX1YLR176C 2436 nt1.48□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YHL037CYHL037C 402 nt1.48□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.48□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 NUT2YPR168W 474 nt1.48□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 JIP5YPR169W 1479 nt1.48□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YOR019WYOR019W 2193 nt1.47□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.47□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 snR43snR43 209 nt1.47□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 ADR1YDR216W 3972 nt1.47□□□□□ -2.17
TPT1Q12272 MVP1YMR004W 1536 nt1.46□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 MLH3YPL164C 2148 nt1.46□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 SPC110YDR356W 2835 nt1.46□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 DNA2YHR164C 4569 nt1.46□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 YLL032CYLL032C 2478 nt1.45□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 MRPL31YKL138C 396 nt1.45□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.45□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 SPO24YPR036W-A 204 nt1.45□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 YPR197CYPR197C 564 nt1.45□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.45□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 CSN9YDR179C 489 nt1.44□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 PAU2YEL049W 363 nt1.44□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 SFB2YNL049C 2631 nt1.44□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 SGO1YOR073W 1773 nt1.44□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 KCS1YDR017C 3153 nt1.43□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 BIL1YOR304C-A 231 nt1.43□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 snR51snR51 107 nt1.43□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 SKP2YNL311C 2292 nt1.43□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 RPS20YHL015W 366 nt1.42□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 YJL135WYJL135W 318 nt1.42□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 RPB10YOR210W 213 nt1.42□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 PMD1YER132C 5262 nt1.42□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 YOR093CYOR093C 4947 nt1.42□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 POL5YEL055C 3069 nt1.42□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 ATG11YPR049C 3537 nt1.42□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 SLY1YDR189W 2001 nt1.42□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 SKI3YPR189W 4299 nt1.42□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 MUK1YPL070W 1839 nt1.41□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 snR72snR72 98 nt1.41□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.41□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.41□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 YNL058CYNL058C 951 nt1.41□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 RKM1YPL208W 1752 nt1.41□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 DGR2YKL121W 2559 nt1.41□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 PIG1YLR273C 1947 nt1.4□□□□□ -2.18
TPT1Q12272 DNF3YMR162C 4971 nt1.4□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.4□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.4□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.4□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YJL022WYJL022W 309 nt1.4□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 SMC4YLR086W 4257 nt1.4□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 ENV11YGR071C 2583 nt1.39□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 SXM1YDR395W 2835 nt1.39□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 ATP7YKL016C 525 nt1.39□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YAF9YNL107W 681 nt1.39□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 TIM18YOR297C 579 nt1.39□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 SAS3YBL052C 2496 nt1.39□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 CTF4YPR135W 2784 nt1.38□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.38□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 COF1YLL050C 432 nt1.38□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 RPL38YLR325C 237 nt1.38□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YOR199WYOR199W 330 nt1.38□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 ALK1YGL021W 2283 nt1.38□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 RAD50YNL250W 3939 nt1.38□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YBP1YBR216C 2025 nt1.37□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 RPL35AYDL191W 363 nt1.37□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 Q0142Q0142 177 nt1.37□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 RPL40BYKR094C 387 nt1.37□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.37□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YBR174CYBR174C 315 nt1.37□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 CHS1YNL192W 3396 nt1.36□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 INP2YMR163C 2118 nt1.36□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 HKR1YDR420W 5409 nt1.36□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 SEC5YDR166C 2916 nt1.36□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 EMC5YIL027C 426 nt1.36□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 APL2YKL135C 2181 nt1.36□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YDR426CYDR426C 378 nt1.35□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YGL217CYGL217C 342 nt1.35□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.35□□□□□ -2.19
TPT1Q12272 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.35□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 123.3 ms