Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.77□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 IRC23YOR044W 474 nt1.77□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YBR012CYBR012C 420 nt1.77□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 HSL1YKL101W 4557 nt1.77□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 MSH5YDL154W 2706 nt1.77□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YJR003CYJR003C 1560 nt1.76□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 MDM20YOL076W 2391 nt1.76□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 CYC7YEL039C 342 nt1.76□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YHL041WYHL041W 450 nt1.76□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.76□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 VPS15YBR097W 4365 nt1.75□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.75□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 TRX1YLR043C 312 nt1.75□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 UTP21YLR409C 2820 nt1.75□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 RFX1YLR176C 2436 nt1.75□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 SLY1YDR189W 2001 nt1.74□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 SRP14YDL092W 441 nt1.74□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.74□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 MLH3YPL164C 2148 nt1.74□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 LRE1YCL051W 1752 nt1.73□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 RPL31AYDL075W 342 nt1.73□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.73□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 PAC1YOR269W 1485 nt1.73□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 MYO2YOR326W 4725 nt1.73□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 PKH3YDR466W 2697 nt1.73□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 MON2YNL297C 4911 nt1.72□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 UPS1YLR193C 528 nt1.72□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YAR053WYAR053W 297 nt1.72□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.72□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 SFB2YNL049C 2631 nt1.71□□□□□ -2.13
NMD4Q12129 RTP1YMR185W 2946 nt1.71□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 YHL037CYHL037C 402 nt1.71□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.71□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 NUT2YPR168W 474 nt1.71□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 TDA9YML081W 3756 nt1.7□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 YLL032CYLL032C 2478 nt1.69□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 SKI3YPR189W 4299 nt1.69□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 MUK1YPL070W 1839 nt1.69□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 MRPL31YKL138C 396 nt1.69□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 BIL1YOR304C-A 231 nt1.69□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 SAS3YBL052C 2496 nt1.69□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 DGR2YKL121W 2559 nt1.69□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 CTF4YPR135W 2784 nt1.68□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 YOR093CYOR093C 4947 nt1.68□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 YNL058CYNL058C 951 nt1.68□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 RPB10YOR210W 213 nt1.68□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 SAR1YPL218W 573 nt1.68□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 YPR197CYPR197C 564 nt1.68□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 PAU2YEL049W 363 nt1.67□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.67□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 CFT1YDR301W 4074 nt1.67□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 REV3YPL167C 4515 nt1.67□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 SEC5YDR166C 2916 nt1.66□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.66□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 snR51snR51 107 nt1.66□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 SGO1YOR073W 1773 nt1.65□□□□□ -2.14
NMD4Q12129 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.65□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.65□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 PIG1YLR273C 1947 nt1.65□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YOR019WYOR019W 2193 nt1.65□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YHR210CYHR210C 1026 nt1.64□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.64□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 TBS1YBR150C 3285 nt1.64□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 EMC5YIL027C 426 nt1.63□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.63□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 RAD50YNL250W 3939 nt1.62□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 snR72snR72 98 nt1.62□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 RPL38YLR325C 237 nt1.62□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.62□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 ADR1YDR216W 3972 nt1.62□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 SMC4YLR086W 4257 nt1.62□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 MEC1YBR136W 7107 nt1.61□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 CSN9YDR179C 489 nt1.61□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YJL022WYJL022W 309 nt1.61□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 SDH2YLL041C 801 nt1.61□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.61□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 SPO24YPR036W-A 204 nt1.61□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 INP2YMR163C 2118 nt1.61□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 RIM20YOR275C 1986 nt1.61□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 MVP1YMR004W 1536 nt1.61□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 RPS20YHL015W 366 nt1.6□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YJL135WYJL135W 318 nt1.6□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 COF1YLL050C 432 nt1.6□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 DNF3YMR162C 4971 nt1.6□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 RKM1YPL208W 1752 nt1.59□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 APL2YKL135C 2181 nt1.59□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 NCA2YPR155C 1851 nt1.59□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.59□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 ZIP2YGL249W 2115 nt1.59□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YOR199WYOR199W 330 nt1.59□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YOR376WYOR376W 369 nt1.59□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.59□□□□□ -2.15
NMD4Q12129 NOC3YLR002C 1992 nt1.59□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 UFD2YDL190C 2886 nt1.59□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 ALK1YGL021W 2283 nt1.59□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YLR419WYLR419W 4308 nt1.59□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 TRM3YDL112W 4311 nt1.58□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 RPL40BYKR094C 387 nt1.58□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YLR140WYLR140W 327 nt1.58□□□□□ -2.16
NMD4Q12129 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.58□□□□□ -2.16
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