Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 NPC2YDL046W 522 nt2.57□□□□□ -2
NSE3Q05541 YLR255CYLR255C 354 nt2.57□□□□□ -2
NSE3Q05541 RFX1YLR176C 2436 nt2.57□□□□□ -2
NSE3Q05541 PLC1YPL268W 2610 nt2.56□□□□□ -2
NSE3Q05541 RPL37BYDR500C 267 nt2.56□□□□□ -2
NSE3Q05541 TRA1YHR099W 11235 nt2.56□□□□□ -2
NSE3Q05541 YIL102CYIL102C 306 nt2.55□□□□□ -2
NSE3Q05541 PAU18YLL064C 363 nt2.55□□□□□ -2
NSE3Q05541 CFT2YLR115W 2580 nt2.55□□□□□ -2
NSE3Q05541 PAU6YNR076W 363 nt2.55□□□□□ -2
NSE3Q05541 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.55□□□□□ -2
NSE3Q05541 snR51snR51 107 nt2.55□□□□□ -2
NSE3Q05541 HCS1YKL017C 2052 nt2.54□□□□□ -2
NSE3Q05541 YDR426CYDR426C 378 nt2.54□□□□□ -2
NSE3Q05541 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.54□□□□□ -2
NSE3Q05541 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.54□□□□□ -2
NSE3Q05541 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.54□□□□□ -2
NSE3Q05541 LYS14YDR034C 2373 nt2.53□□□□□ -2
NSE3Q05541 ZRG17YNR039C 1818 nt2.53□□□□□ -2
NSE3Q05541 YOL098CYOL098C 3114 nt2.53□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 DCP2YNL118C 2913 nt2.52□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 ARP7YPR034W 1434 nt2.52□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 DBP6YNR038W 1890 nt2.52□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.52□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YGR265WYGR265W 411 nt2.52□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 TRX1YLR043C 312 nt2.52□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 INP2YMR163C 2118 nt2.52□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.51□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 HMRA2YCR096C 360 nt2.5□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 MCM22YJR135C 720 nt2.5□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.5□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YCL046WYCL046W 324 nt2.5□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 MAK10YEL053C 2202 nt2.5□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 IRC8YJL051W 2469 nt2.49□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YDR344CYDR344C 444 nt2.49□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 RPB10YOR210W 213 nt2.49□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 FAB1YFR019W 6837 nt2.49□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 ZIP1YDR285W 2628 nt2.48□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 CAT2YML042W 2013 nt2.48□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.48□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 DGR1YNL130C-A 147 nt2.48□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 HER1YOR227W 3741 nt2.48□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YHL042WYHL042W 453 nt2.47□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.47□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YIL032CYIL032C 357 nt2.47□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.47□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 YPR063CYPR063C 423 nt2.47□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 RGA1YOR127W 3024 nt2.47□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 CTR9YOL145C 3234 nt2.47□□□□□ -2.01
NSE3Q05541 NOP14YDL148C 2433 nt2.46□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 snR8snR8 190 nt2.46□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.46□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 YGR250CYGR250C 2346 nt2.46□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 BUD2YKL092C 3315 nt2.45□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 TDA9YML081W 3756 nt2.45□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 CHC1YGL206C 4962 nt2.45□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.45□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 YDR366CYDR366C 399 nt2.45□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.45□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 YLL032CYLL032C 2478 nt2.45□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 IRE1YHR079C 3348 nt2.45□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 MVP1YMR004W 1536 nt2.44□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 HMI1YOL095C 2121 nt2.43□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.43□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 SAC3YDR159W 3906 nt2.43□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 TOR2YKL203C 7425 nt2.43□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 KIP1YBL063W 3336 nt2.43□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 PEP1YBL017C 4740 nt2.43□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 FKS1YLR342W 5631 nt2.42□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 MSC6YOR354C 2079 nt2.42□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 ALG13YGL047W 609 nt2.42□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 YJL015CYJL015C 285 nt2.42□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 SEY1YOR165W 2331 nt2.41□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 COG8YML071C 1824 nt2.41□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 YGR069WYGR069W 336 nt2.41□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 TOF1YNL273W 3717 nt2.41□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 MSH5YDL154W 2706 nt2.41□□□□□ -2.02
NSE3Q05541 SAS3YBL052C 2496 nt2.4□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 YDL118WYDL118W 381 nt2.4□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 ATG9YDL149W 2994 nt2.4□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 YDL211CYDL211C 1119 nt2.4□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.4□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 YJL135WYJL135W 318 nt2.39□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 OST1YJL002C 1431 nt2.39□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 SEC63YOR254C 1992 nt2.39□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 MLH3YPL164C 2148 nt2.39□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 RLM1YPL089C 2031 nt2.39□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 snR72snR72 98 nt2.38□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 YBL012CYBL012C 402 nt2.38□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.38□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 AGC1YPR021C 2709 nt2.38□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 FRK1YPL141C 2598 nt2.37□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 RAD61YDR014W 1944 nt2.37□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 SDH2YLL041C 801 nt2.37□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.37□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 SEC31YDL195W 3822 nt2.36□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 HSH155YMR288W 2916 nt2.36□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 SCW11YGL028C 1629 nt2.36□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 LCD1YDR499W 2244 nt2.36□□□□□ -2.03
NSE3Q05541 snR60snR60 104 nt2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms