Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 SPO23YBR250W 1572 nt0.62□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 PRM8YGL053W 714 nt0.62□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YIL029CYIL029C 429 nt0.62□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YOR248WYOR248W 303 nt0.62□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.62□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 NOC3YLR002C 1992 nt0.62□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YPR117WYPR117W 7470 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 LYS14YDR034C 2373 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 AIM9YER080W 1884 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 SET3YKR029C 2256 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 VMA21YGR105W 234 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 NBL1YHR199C-A 222 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YBR012CYBR012C 420 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 SEC1YDR164C 2175 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 MPT5YGL178W 2580 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.61□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 ENV11YGR071C 2583 nt0.6□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 TOF2YKR010C 2316 nt0.6□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YDL073WYDL073W 2955 nt0.6□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 CYC7YEL039C 342 nt0.6□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YKL044WYKL044W 321 nt0.6□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 SDH2YLL041C 801 nt0.6□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YBR071WYBR071W 636 nt0.6□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YPR039WYPR039W 336 nt0.6□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 NUP157YER105C 4176 nt0.6□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 SLD3YGL113W 2007 nt0.59□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 TMA22YJR014W 597 nt0.59□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.59□□□□□ -2.31
UPS3Q04006 PXA2YKL188C 2562 nt0.59□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 SCW11YGL028C 1629 nt0.58□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YER135CYER135C 393 nt0.58□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.58□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.58□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.58□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.58□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YDR114CYDR114C 303 nt0.57□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YAP3YHL009C 993 nt0.57□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 RPL16AYIL133C 600 nt0.57□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 PAM16YJL104W 450 nt0.57□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YJR141WYJR141W 1044 nt0.57□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.57□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 RPL32YBL092W 393 nt0.57□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 APL2YKL135C 2181 nt0.57□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 STO1YMR125W 2586 nt0.56□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YDL016CYDL016C 303 nt0.56□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 HUR1YGL168W 333 nt0.56□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YOR199WYOR199W 330 nt0.56□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YAR009CYAR009C 3591 nt0.56□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 ALY2YJL084C 3141 nt0.55□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 NHP2YDL208W 471 nt0.55□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.55□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.55□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 PRP16YKR086W 3216 nt0.55□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YLL032CYLL032C 2478 nt0.55□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 FIG4YNL325C 2640 nt0.54□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YDL206WYDL206W 2289 nt0.54□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 RKR1YMR247C 4689 nt0.54□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YDL196WYDL196W 330 nt0.54□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YDR521WYDR521W 336 nt0.54□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.54□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 BER1YLR412W 825 nt0.54□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 CMC4YMR194C-B 222 nt0.54□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 OCA6YDR067C 675 nt0.53□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 SWF1YDR126W 1011 nt0.53□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 MXR1YER042W 555 nt0.53□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YFL012WYFL012W 447 nt0.53□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.53□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 UPS1YLR193C 528 nt0.53□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.53□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 UBX4YMR067C 1251 nt0.53□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.53□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 SLY1YDR189W 2001 nt0.53□□□□□ -2.32
UPS3Q04006 AIM44YPL158C 2277 nt0.53□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 RIM20YOR275C 1986 nt0.52□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 LCD1YDR499W 2244 nt0.52□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 MRPL31YKL138C 396 nt0.52□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 SVS1YPL163C 783 nt0.52□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 PDE2YOR360C 1581 nt0.52□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 RFX1YLR176C 2436 nt0.52□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 SNU56YDR240C 1479 nt0.51□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.51□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 YGR025WYGR025W 303 nt0.51□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 RRT1YBL048W 312 nt0.51□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 snR78snR78 87 nt0.5□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 YGR042WYGR042W 816 nt0.5□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.5□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 APQ13YJL075C 417 nt0.5□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 snR13snR13 124 nt0.5□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 RCN2YOR220W 798 nt0.5□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 SWI6YLR182W 2412 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 YGL239CYGL239C 315 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.49□□□□□ -2.33
UPS3Q04006 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.49□□□□□ -2.33
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