Protein–RNA interactions for Protein: P38874

IKI1, Elongator complex protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IKI1P38874 HIT1YJR055W 495 nt0.72□□□□□ -2.29
IKI1P38874 FIG4YNL325C 2640 nt0.71□□□□□ -2.3
IKI1P38874 snR84snR84 550 nt0.71□□□□□ -2.3
IKI1P38874 AFB1YLR040C 675 nt0.71□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YLR198CYLR198C 360 nt0.71□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.71□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YOR248WYOR248W 303 nt0.71□□□□□ -2.3
IKI1P38874 STO1YMR125W 2586 nt0.7□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YJR087WYJR087W 351 nt0.7□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YOR199WYOR199W 330 nt0.7□□□□□ -2.3
IKI1P38874 PPN1YDR452W 2025 nt0.7□□□□□ -2.3
IKI1P38874 SHE9YDR393W 1371 nt0.7□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.69□□□□□ -2.3
IKI1P38874 SLX9YGR081C 633 nt0.69□□□□□ -2.3
IKI1P38874 SDH2YLL041C 801 nt0.69□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YLR366WYLR366W 306 nt0.69□□□□□ -2.3
IKI1P38874 GMC2YLR445W 567 nt0.69□□□□□ -2.3
IKI1P38874 PDE2YOR360C 1581 nt0.69□□□□□ -2.3
IKI1P38874 MXR1YER042W 555 nt0.68□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YOL029CYOL029C 606 nt0.68□□□□□ -2.3
IKI1P38874 DCP1YOL149W 696 nt0.68□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YAR009CYAR009C 3591 nt0.68□□□□□ -2.3
IKI1P38874 PXA2YKL188C 2562 nt0.67□□□□□ -2.3
IKI1P38874 NBL1YHR199C-A 222 nt0.67□□□□□ -2.3
IKI1P38874 SWI6YLR182W 2412 nt0.67□□□□□ -2.3
IKI1P38874 ALY2YJL084C 3141 nt0.67□□□□□ -2.3
IKI1P38874 MMS4YBR098W 2076 nt0.66□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YDL196WYDL196W 330 nt0.66□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.66□□□□□ -2.3
IKI1P38874 UPS1YLR193C 528 nt0.66□□□□□ -2.3
IKI1P38874 SLY1YDR189W 2001 nt0.65□□□□□ -2.3
IKI1P38874 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.65□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.65□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.65□□□□□ -2.31
IKI1P38874 GRX5YPL059W 453 nt0.65□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YDL073WYDL073W 2955 nt0.64□□□□□ -2.31
IKI1P38874 LCD1YDR499W 2244 nt0.64□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.64□□□□□ -2.31
IKI1P38874 ENV11YGR071C 2583 nt0.64□□□□□ -2.31
IKI1P38874 SLD3YGL113W 2007 nt0.64□□□□□ -2.31
IKI1P38874 APL2YKL135C 2181 nt0.63□□□□□ -2.31
IKI1P38874 OCA6YDR067C 675 nt0.63□□□□□ -2.31
IKI1P38874 SPO11YHL022C 1197 nt0.63□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.63□□□□□ -2.31
IKI1P38874 PAM16YJL104W 450 nt0.63□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.63□□□□□ -2.31
IKI1P38874 SEC1YDR164C 2175 nt0.63□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YLL032CYLL032C 2478 nt0.62□□□□□ -2.31
IKI1P38874 UBP3YER151C 2739 nt0.62□□□□□ -2.31
IKI1P38874 NHP2YDL208W 471 nt0.62□□□□□ -2.31
IKI1P38874 SWF1YDR126W 1011 nt0.62□□□□□ -2.31
IKI1P38874 TMA22YJR014W 597 nt0.62□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.62□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YPR039WYPR039W 336 nt0.62□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YIL029CYIL029C 429 nt0.61□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YIL059CYIL059C 366 nt0.61□□□□□ -2.31
IKI1P38874 PRP21YJL203W 843 nt0.61□□□□□ -2.31
IKI1P38874 ILM1YJR118C 612 nt0.61□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.61□□□□□ -2.31
IKI1P38874 RRT1YBL048W 312 nt0.61□□□□□ -2.31
IKI1P38874 YDR521WYDR521W 336 nt0.6□□□□□ -2.31
IKI1P38874 VMA21YGR105W 234 nt0.6□□□□□ -2.31
IKI1P38874 CMC4YMR194C-B 222 nt0.6□□□□□ -2.31
IKI1P38874 IES4YOR189W 351 nt0.6□□□□□ -2.31
IKI1P38874 WAR1YML076C 2835 nt0.6□□□□□ -2.31
IKI1P38874 ALG13YGL047W 609 nt0.59□□□□□ -2.31
IKI1P38874 MRPL31YKL138C 396 nt0.59□□□□□ -2.31
IKI1P38874 RFX1YLR176C 2436 nt0.59□□□□□ -2.32
IKI1P38874 SLI15YBR156C 2097 nt0.58□□□□□ -2.32
IKI1P38874 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.58□□□□□ -2.32
IKI1P38874 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.58□□□□□ -2.32
IKI1P38874 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.58□□□□□ -2.32
IKI1P38874 YNL050CYNL050C 813 nt0.58□□□□□ -2.32
IKI1P38874 IRC16YPR038W 360 nt0.58□□□□□ -2.32
IKI1P38874 YPR153WYPR153W 423 nt0.58□□□□□ -2.32
IKI1P38874 RKR1YMR247C 4689 nt0.58□□□□□ -2.32
IKI1P38874 DBP6YNR038W 1890 nt0.57□□□□□ -2.32
IKI1P38874 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.57□□□□□ -2.32
IKI1P38874 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.57□□□□□ -2.32
IKI1P38874 PRP16YKR086W 3216 nt0.57□□□□□ -2.32
IKI1P38874 NPC2YDL046W 522 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 MET32YDR253C 576 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 APQ13YJL075C 417 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 RPL32YBL092W 393 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 RCN2YOR220W 798 nt0.56□□□□□ -2.32
IKI1P38874 ISD11YER048W-A 285 nt0.54□□□□□ -2.32
IKI1P38874 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.54□□□□□ -2.32
IKI1P38874 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.54□□□□□ -2.32
IKI1P38874 YKL044WYKL044W 321 nt0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 142.6 ms