Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LINC00271P0C7V0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00271P0C7V0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms