Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM106CQ9BVX2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms