RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437051.5

SGO1-208, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-208ENST00000437051 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.57■■■■■ 5.05
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SGO1-208ENST00000437051 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.77■■■■□ 3.8
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SGO1-208ENST00000437051 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.86■■■■□ 3.65
SGO1-208ENST00000437051 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.48■■■■□ 3.59
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SGO1-208ENST00000437051 SMARCA2P51531 1590 aa36.1■■■■□ 3.37
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SGO1-208ENST00000437051 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.97■■■■□ 3.35
SGO1-208ENST00000437051 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.93■■■■□ 3.34
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SGO1-208ENST00000437051 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.28■■■■□ 3.24
SGO1-208ENST00000437051 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.28■■■■□ 3.24
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SGO1-208ENST00000437051 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.14■■■■□ 3.22
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SGO1-208ENST00000437051 WDR62O43379 1518 aa34.87■■■■□ 3.17
SGO1-208ENST00000437051 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.79■■■■□ 3.16
SGO1-208ENST00000437051 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.78■■■■□ 3.16
SGO1-208ENST00000437051 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.64■■■■□ 3.14
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SGO1-208ENST00000437051 PRDM2Q13029 1718 aa34.56■■■■□ 3.12
SGO1-208ENST00000437051 TOPBP1Q92547 1522 aa34.2■■■■□ 3.07
SGO1-208ENST00000437051 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
SGO1-208ENST00000437051 IFT140Q96RY7 1462 aa34.08■■■■□ 3.05
SGO1-208ENST00000437051 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.08■■■■□ 3.05
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SGO1-208ENST00000437051 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
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SGO1-208ENST00000437051 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.61■■■□□ 2.97
SGO1-208ENST00000437051 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.61■■■□□ 2.97
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SGO1-208ENST00000437051 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
SGO1-208ENST00000437051 WDR97A6NE52 1622 aa33.53■■■□□ 2.96
SGO1-208ENST00000437051 ARHGEF11O15085 1522 aa33.5■■■□□ 2.95
SGO1-208ENST00000437051 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.44■■■□□ 2.94
SGO1-208ENST00000437051 GRIN2BQ13224 1484 aa33.33■■■□□ 2.93
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SGO1-208ENST00000437051 FBLN2P98095 1184 aa33.32■■■□□ 2.92
SGO1-208ENST00000437051 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.31■■■□□ 2.92
SGO1-208ENST00000437051 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.31■■■□□ 2.92
SGO1-208ENST00000437051 PBRM1Q86U86 1689 aa33.29■■■□□ 2.92
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SGO1-208ENST00000437051 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.25■■■□□ 2.91
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SGO1-208ENST00000437051 KIF27Q86VH2 1401 aa32.46■■■□□ 2.79
SGO1-208ENST00000437051 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
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