Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BEST4Q8NFU0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BEST4Q8NFU0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms