Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 UBP11YKR098C 2154 nt3.65□□□□□ -1.82
YRR1Q12172 YNL144CYNL144C 2223 nt3.65□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 PAU3YCR104W 375 nt3.65□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 YNL114CYNL114C 372 nt3.65□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 TAF1YGR274C 3201 nt3.65□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 HOS4YIL112W 3252 nt3.64□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 YGL140CYGL140C 3660 nt3.64□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 ALA1YOR335C 2877 nt3.63□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 SNF5YBR289W 2718 nt3.63□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 RPL42BYHR141C 321 nt3.63□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 YAT2YER024W 2772 nt3.63□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 SET1YHR119W 3243 nt3.63□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 SMY2YBR172C 2223 nt3.62□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 MNE1YOR350C 1992 nt3.62□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 IRR1YIL026C 3453 nt3.61□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 OSH3YHR073W 2991 nt3.61□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 PTP3YER075C 2787 nt3.61□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 YDL242WYDL242W 354 nt3.61□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 DIA2YOR080W 2199 nt3.61□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 RGM1YMR182C 636 nt3.6□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 YPR022CYPR022C 3402 nt3.6□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 TRS120YDR407C 3870 nt3.6□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 MMS22YLR320W 4365 nt3.6□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 FRE2YKL220C 2136 nt3.59□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 EDS1YBR033W 2760 nt3.59□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 snR76snR76 109 nt3.59□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 PAU10YDR542W 363 nt3.59□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 PAU11YGL261C 363 nt3.59□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 PAU4YLR461W 363 nt3.59□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 RPS8AYBL072C 603 nt3.59□□□□□ -1.83
YRR1Q12172 ATG11YPR049C 3537 nt3.59□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 PUT3YKL015W 2940 nt3.59□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 SKP2YNL311C 2292 nt3.59□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 YIL080WYIL080W 4722 nt3.59□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 RCY1YJL204C 2523 nt3.59□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 CHO2YGR157W 2610 nt3.58□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt3.58□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 UTP14YML093W 2700 nt3.58□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 PIP2YOR363C 2991 nt3.58□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 RAD2YGR258C 3096 nt3.57□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 KSP1YHR082C 3090 nt3.57□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 FUN30YAL019W 3396 nt3.57□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 RIC1YLR039C 3171 nt3.57□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 MDN1YLR106C 14733 nt3.56□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 NUP159YIL115C 4383 nt3.56□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt3.56□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 SMC2YFR031C 3513 nt3.56□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 STE23YLR389C 3084 nt3.55□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 SIN3YOL004W 4611 nt3.55□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 RPL20AYMR242C 519 nt3.55□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 RPL42AYNL162W 321 nt3.55□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 RPA135YPR010C 3612 nt3.55□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 UBP14YBR058C 2346 nt3.55□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 DAN4YJR151C 3486 nt3.54□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 YKU80YMR106C 1890 nt3.54□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 RSF2YJR127C 4143 nt3.54□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 CHS6YJL099W 2241 nt3.54□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 NOP10YHR072W-A 177 nt3.54□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 NET1YJL076W 3570 nt3.54□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 LYS14YDR034C 2373 nt3.54□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 MYO3YKL129C 3819 nt3.54□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 RAD26YJR035W 3258 nt3.53□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 YPR089WYPR089W 2667 nt3.53□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.53□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 HRD3YLR207W 2502 nt3.53□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 SCH9YHR205W 2475 nt3.53□□□□□ -1.84
YRR1Q12172 SWI5YDR146C 2130 nt3.52□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 KAP123YER110C 3342 nt3.52□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 KAP104YBR017C 2757 nt3.52□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 SPA2YLL021W 4401 nt3.52□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 INP52YNL106C 3552 nt3.52□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 URA2YJL130C 6645 nt3.52□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 SLD3YGL113W 2007 nt3.51□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.51□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.51□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 ANB1YJR047C 474 nt3.51□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 ROG1YGL144C 2058 nt3.51□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 SBE22YHR103W 2559 nt3.51□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 PSY2YNL201C 2577 nt3.51□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 SUL1YBR294W 2580 nt3.51□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 TAF2YCR042C 4224 nt3.5□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 DYN2YDR424C 279 nt3.5□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 ZIP2YGL249W 2115 nt3.5□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 PRP6YBR055C 2700 nt3.49□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 snR81snR81 201 nt3.49□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 RPS30BYOR182C 192 nt3.49□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 STE6YKL209C 3873 nt3.49□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 ZIP1YDR285W 2628 nt3.49□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 RCO1YMR075W 2055 nt3.48□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 ARO1YDR127W 4767 nt3.48□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 PRP5YBR237W 2550 nt3.48□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 YFL065CYFL065C 309 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 MBB1YJL199C 327 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 YPR203WYPR203W 309 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 ENA5YDR038C 3276 nt3.47□□□□□ -1.85
YRR1Q12172 ENA2YDR039C 3276 nt3.47□□□□□ -1.85
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