Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 RPL38YLR325C 237 nt2.8□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.8□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.8□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 SWI6YLR182W 2412 nt2.8□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 MET18YIL128W 3099 nt2.79□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 YDR286CYDR286C 345 nt2.79□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 HYP2YEL034W 474 nt2.79□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 YNL114CYNL114C 372 nt2.79□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 YOR333CYOR333C 417 nt2.79□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 NUT2YPR168W 474 nt2.79□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 snR51snR51 107 nt2.79□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 SRB8YCR081W 4284 nt2.79□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 MSB1YOR188W 3414 nt2.79□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 SAP1YER047C 2694 nt2.78□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 MRP10YDL045W-A 288 nt2.78□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 RPL42BYHR141C 321 nt2.78□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 RPL42AYNL162W 321 nt2.78□□□□□ -1.96
SSF2Q12153 HDA3YPR179C 1968 nt2.78□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 VPS13YLL040C 9435 nt2.78□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 VMR1YHL035C 4779 nt2.77□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 SCP160YJL080C 3669 nt2.77□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YRB1YDR002W 606 nt2.77□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 PCC1YKR095W-A 267 nt2.77□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 PAU8YAL068C 363 nt2.77□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 PAU20YOL161C 363 nt2.77□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 MNE1YOR350C 1992 nt2.77□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 STE11YLR362W 2154 nt2.76□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YDR344CYDR344C 444 nt2.76□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YEL057CYEL057C 702 nt2.76□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YIL102CYIL102C 306 nt2.76□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.76□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.76□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 RPS17AYML024W 411 nt2.76□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YOP1YPR028W 543 nt2.76□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 SCD5YOR329C 2619 nt2.76□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 IRR1YIL026C 3453 nt2.76□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YFH1YDL120W 525 nt2.75□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 NUP170YBL079W 4509 nt2.74□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YCR043CYCR043C 384 nt2.74□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 TOR1YJR066W 7413 nt2.74□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 OST1YJL002C 1431 nt2.74□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 CLN3YAL040C 1743 nt2.73□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.73□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 NPC2YDL046W 522 nt2.73□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YJL015CYJL015C 285 nt2.73□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.73□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 RPH1YER169W 2391 nt2.73□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 DBP6YNR038W 1890 nt2.73□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 VPS8YAL002W 3825 nt2.73□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YEF3YLR249W 3135 nt2.72□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 TIM9YEL020W-A 264 nt2.72□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.72□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 APL5YPL195W 2799 nt2.72□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 PXA2YKL188C 2562 nt2.72□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 SWI5YDR146C 2130 nt2.72□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 NOP53YPL146C 1368 nt2.72□□□□□ -1.97
SSF2Q12153 HOP2YGL033W 657 nt2.71□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 UPS1YLR193C 528 nt2.71□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 UBR1YGR184C 5853 nt2.7□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 SLY1YDR189W 2001 nt2.7□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YDR426CYDR426C 378 nt2.7□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.7□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 SVL3YPL032C 2478 nt2.7□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YPR097WYPR097W 3222 nt2.7□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 CDC60YPL160W 3273 nt2.69□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 TFC8YPL007C 1767 nt2.69□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 CFT2YLR115W 2580 nt2.69□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 CYC7YEL039C 342 nt2.69□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 LCL1YPL056C 306 nt2.69□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.69□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 MUK1YPL070W 1839 nt2.69□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 EMP24YGL200C 612 nt2.68□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 MCM22YJR135C 720 nt2.68□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.68□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 TRL1YJL087C 2484 nt2.68□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YGR265WYGR265W 411 nt2.67□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 SSQ1YLR369W 1974 nt2.67□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 UBP15YMR304W 3693 nt2.66□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 SEC16YPL085W 6588 nt2.66□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 SAP190YKR028W 3102 nt2.66□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YDL211CYDL211C 1119 nt2.66□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YHL042WYHL042W 453 nt2.66□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YIL032CYIL032C 357 nt2.66□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 CYB5YNL111C 363 nt2.66□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YDR341CYDR341C 1824 nt2.65□□□□□ -1.98
SSF2Q12153 YDL062WYDL062W 426 nt2.65□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 VTC1YER072W 390 nt2.65□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 YGR069WYGR069W 336 nt2.65□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 PEX4YGR133W 552 nt2.65□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 YPR063CYPR063C 423 nt2.65□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 PET309YLR067C 2898 nt2.65□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 RFX1YLR176C 2436 nt2.64□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 HCS1YKL017C 2052 nt2.64□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 COG8YML071C 1824 nt2.64□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 SIR4YDR227W 4077 nt2.64□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 INP2YMR163C 2118 nt2.64□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.64□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 GIP3YPL137C 3831 nt2.63□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 YGR250CYGR250C 2346 nt2.63□□□□□ -1.99
SSF2Q12153 ALG13YGL047W 609 nt2.63□□□□□ -1.99
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