Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 GDS1YOR355W 1569 nt0.72□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.72□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 RPL9BYNL067W 576 nt0.72□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 PAU24YBR301W 363 nt0.72□□□□□ -2.29
YHP1Q04116 YDR220CYDR220C 294 nt0.71□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 RTR1YER139C 681 nt0.71□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 LRP1YHR081W 555 nt0.71□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.71□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YIR020CYIR020C 303 nt0.71□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 PAM16YJL104W 450 nt0.71□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 RPS18BYML026C 441 nt0.71□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.71□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 SCC2YDR180W 4482 nt0.7□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 SRP14YDL092W 441 nt0.7□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YHR054CYHR054C 1065 nt0.7□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YKL111CYKL111C 336 nt0.7□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YOR029WYOR029W 336 nt0.7□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YPL197CYPL197C 414 nt0.7□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 POP7YBR167C 423 nt0.7□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 ZRG17YNR039C 1818 nt0.7□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 BI4Q0120 1917 nt0.7□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 SWI4YER111C 3282 nt0.69□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 CDC39YCR093W 6327 nt0.69□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 STB6YKL072W 2301 nt0.69□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YCR100CYCR100C 951 nt0.69□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YPT6YLR262C 648 nt0.69□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 SPT21YMR179W 2277 nt0.69□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 HDA3YPR179C 1968 nt0.68□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 BUD3YCL014W 4911 nt0.68□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 DOP1YDR141C 5097 nt0.68□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 SMB1YER029C 591 nt0.68□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 TIM10YHR005C-A 282 nt0.68□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 TMA22YJR014W 597 nt0.68□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 SDS22YKL193C 1017 nt0.68□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 IRC23YOR044W 474 nt0.68□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YGL109WYGL109W 324 nt0.67□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 SWS2YNL081C 432 nt0.67□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YPR096CYPR096C 303 nt0.67□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 SAS3YBL052C 2496 nt0.66□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 ZIP1YDR285W 2628 nt0.66□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 SWI5YDR146C 2130 nt0.66□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 SEM1YDR363W-A 270 nt0.66□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.66□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YGL015CYGL015C 393 nt0.66□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YGR228WYGR228W 345 nt0.66□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 APL3YBL037W 3078 nt0.66□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 UTP13YLR222C 2454 nt0.65□□□□□ -2.3
YHP1Q04116 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.65□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.65□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 NBP1YLR457C 960 nt0.65□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YMR254CYMR254C 309 nt0.65□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YOP1YPR028W 543 nt0.65□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 PRP16YKR086W 3216 nt0.65□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 PAC1YOR269W 1485 nt0.65□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 SEC1YDR164C 2175 nt0.64□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 HNT1YDL125C 477 nt0.64□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YDL152WYDL152W 366 nt0.64□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.64□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 RPC10YHR143W-A 213 nt0.64□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YLR271WYLR271W 825 nt0.64□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 RPS30BYOR182C 192 nt0.64□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YCL002CYCL002C 792 nt0.64□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 AIM9YER080W 1884 nt0.64□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 NOC3YLR002C 1992 nt0.63□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 TOF2YKR010C 2316 nt0.63□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 QCR7YDR529C 384 nt0.63□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 PRM8YGL053W 714 nt0.63□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.63□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YDL073WYDL073W 2955 nt0.63□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 MPT5YGL178W 2580 nt0.62□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 NUP145YGL092W 3954 nt0.62□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 CYC7YEL039C 342 nt0.62□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 MND1YGL183C 660 nt0.62□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.62□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YBR063CYBR063C 1215 nt0.62□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.62□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.61□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 SLX9YGR081C 633 nt0.61□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YAL066WYAL066W 309 nt0.61□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 NUT2YPR168W 474 nt0.61□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 GPM2YDL021W 936 nt0.6□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 NHP2YDL208W 471 nt0.6□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 snR9snR9 187 nt0.6□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YDR509WYDR509W 348 nt0.6□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 INA22YIR024C 651 nt0.6□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 CSM4YPL200W 471 nt0.6□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YPR099CYPR099C 357 nt0.6□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 PAN3YKL025C 2040 nt0.6□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 NUT1YGL151W 3399 nt0.6□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 PIG1YLR273C 1947 nt0.6□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 AIM44YPL158C 2277 nt0.59□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 RPL16AYIL133C 600 nt0.59□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.59□□□□□ -2.31
YHP1Q04116 MKT1YNL085W 2493 nt0.59□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 snR84snR84 550 nt0.58□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.58□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.58□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 CMC4YMR194C-B 222 nt0.58□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 YBR012CYBR012C 420 nt0.58□□□□□ -2.32
YHP1Q04116 FIG4YNL325C 2640 nt0.58□□□□□ -2.32
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